1998年，深圳市集裝箱運輸EDI項目正式啟動。深圳市集裝箱運輸EDI項目按“政府推動，企業運作”的方式，成立深圳市鵬海運電子數據交換有限公司負責具體運作。
1999年，按照國家交通部的統壹規劃，“深圳市集裝箱運輸EDI中心”更名為“深圳市交通運輸EDI信息網絡中心”。
1999年，完成深圳各主要碼頭的上網工作，實現了船圖和箱動態信息EDI報文的傳送交換，同時，掛靠深圳港口所有國際班輪公司均接入EDI系統並正式投產。
2000年，深圳市確定現代物流業為支柱產業，要大力建設和完善物流業發展的政策平臺、基礎設施平臺、公***信息平臺。
2001年8月，深圳市政府、深圳海關聯合推動深圳市加工貿易企業聯網監管工程。
2001年10月，深圳市政府召開專門會議，確定深圳市交通運輸EDI信息網絡中心為深圳市現代物流信息網絡技術中心。深圳市“十五”及2015年現代物流業發展規劃確定了物流信息平臺的建設規劃，將EDI平臺發展成為深圳市物流信息公***平臺的目標。
2002年5月，深圳市現代物流信息網絡平臺建設工程被國家科技部確定為首批全國智能交通系統應用示範工程試點項目。
2002年，與深圳市海事局合作，啟動深圳海事執法系統信息化工程。
2003年，配合深圳海關完成了深圳出口加工區信息平臺的建立。
2003年，與深圳海關及鹽田國際碼頭聯合開發的深圳海關推進空箱快速通關系統項目啟動。
2003年，海關總署和深圳市政府簽署合作備忘錄，***同推進建設深圳電子口岸平臺。
2003年，作為市政府的授權代表參與建設深圳市電子口岸平臺及其應用推廣機構。
2004年，與中國電子口岸深圳數據分中心、東方口岸科技有限公司合作成立了“深圳南方電子口岸有限公司”；
2004年，研究開發“物流之星” 軟件系統，向供應鏈提供綜合電子化物流系統服務；
2005年，承擔深圳市物流辦、交通局的《深圳市物流信息公***平臺構建方案研究》課題。
2006年，啟動策劃、建設海運業務綜合處理系統（即海商網項目），提供基於海運業務系統數據***享的綜合信息服務；
2007年，受深圳市交通局委托，承擔深圳港集裝箱港口建設費征費系統與相關單位之間的EDI數據傳輸和監控工作；
2008年，受深圳市交通局委托，承擔深圳港航線統計工作。