對於法院委托的司法鑒定，大部分法院的做法是先代替司法鑒定所收費，再委托司法鑒定所進行鑒定。
有的法院還要求當事人和法院壹起去司法鑒定所，當事人自己向司法鑒定所繳納鑒定費。
無論鑒定費怎麽交，鑒定後都沒有鑒定所同意收費。
《最高人民法院關於適用〈中華人民共和國民事訴訟法〉的解釋》第121條規定:
當事人可以在舉證期限屆滿前申請鑒定。人民法院不得允許申請鑒定的事項與待證明的事實無關，或者對待證明的事實無證明意義。
人民法院允許當事人申請專家鑒定的，應當組織當事人協商確定具有相應資質的鑒定人。當事人協商不成的，由人民法院指定。
符合依職權調查收集證據條件的，人民法院應當依職權委托專家鑒定，並在征求當事人意見後，指定具有相應資質的專家進行鑒定。
擴展數據:
司法鑒定收費項目和標準的基準價格；
第二條:司法鑒定收費是指司法鑒定機構依法接受委托，運用科學技術或者專門知識對訴訟中涉及的專門性問題進行鑒定、判斷並提供鑒定意見，司法鑒定機構向委托人收取服務費的行為。
第三條司法鑒定收費應當遵循公開、公平、誠實信用、等價有償、委托人付費的原則。
第四條司法鑒定收費標準應當按照有利於司法鑒定可持續發展並兼顧社會承受能力的原則制定。
第五條法醫學、物證、視聽資料等司法鑒定收費實行政府指導價或者政府定價管理。
第六條國務院價格主管部門會同同級司法行政部門負責制定《司法鑒定收費管理辦法》和法醫學、物證、視聽資料收費標準基準價(司法鑒定收費標準基準價(試行)附後)。
第七條省級價格主管部門會同同級司法行政部門，結合本地實際，參考法醫、物證、視聽資料收費標準。
基準價應當設定具體的收費標準，或者在法醫、物證、視聽資料收費標準基準價的基礎上設定浮動幅度。
除《司法鑒定收費標準基準價(試行)》外，新增的法醫學、物證、視聽資料司法鑒定收費標準由省級物價部門會同同級司法行政部門制定；國務院價格主管部門會同同級司法行政部門根據各地新的收費項目和收費標準，適時制定全國統壹的司法鑒定收費項目和收費標準基準價。
法醫學、物證、視聽資料以外的司法鑒定收費標準，由省級價格主管部門會同同級司法行政部門根據當地實際情況確定。國務院價格主管部門另有規定的，從其規定。
第八條涉財產案件司法鑒定費用按照訴訟標的和鑒定標的價值較小者分期累計收取。具體比例如下:
(壹)不超過654.38+萬元，按照本辦法附件所列收費標準收費；
(二)超過65438+萬元至50萬元的，按1%計收；
(三)50萬元以上至654.38+0萬元的部分，按0.8%計收；
(四)654.38+0萬元至200萬元以上部分，按0.6%計收；
(五)超過200萬元至500萬元的，按0.4%征收；
(六)超過500萬元至654.38+00萬元的部分，按0.2%計收；
(七)超過654.38+00萬元的，按0.1%計。
對於標的額較大的，省級價格主管部門應當會同同級司法機關。
行政部門應當根據當地實際情況制定司法鑒定費數額上限。
本條第壹款所稱涉財產案件司法鑒定收費，僅適用於司法鑒定中的物證文件鑒定和痕跡鑒定中的指紋鑒定，不適用於其他鑒定。
第九條司法鑒定機構接受委托提供司法鑒定服務，應當與委托人簽訂司法鑒定協議，明確收費項目、收費標準、收費方式、收費金額、結算方式、爭議解決方式等條款。
第十條司法鑒定機構需要收取或者墊付費用的，應當事先與委托人達成協議，並由雙方簽字確認。
第十壹條司法鑒定機構接受委托提供司法鑒定服務時，單方邀請專家參與鑒定或者出具咨詢意見的，其費用由司法鑒定機構承擔，但經委托人同意的除外。
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