1.實施範圍不同
企業財務通則在金融企業除外的具備法人資格的國有及國有控股企業執行(其他企業參照執行)。
企業會計準則目前僅在上市公司、金融企業、中央企業執行，在所有企業執行還需要二至三年時間。
2.側重內容不同
企業財務通則壹方面將原會計與稅務內容交由相關制度進行規範，另壹方面對同時涉及財務與會計的相關問題進行強化陳述，側重於指導企業財務管理體系的建立。
企業會計準則主要規範企業會計確認、計量和報告行為，保證會計信息質量。主要內容參照國際會計準則，包括1個基本準則和38個具體會計準則。是對資產、負債、權益、收入、成本、利潤等會計要素進行確認、計量和報告，為有關方面提供決策依據，會計核算為企業財務管理提供基礎，重在對財務行為的過程核算和結果反映，側重於指導企業會計核算體系的建立。
頒發及實施構：我國《企業會計準則》《企業財務通則》都是由國務院財政部制定並頒布。