受災最嚴重的臺灣縣市為：屏東縣 高雄縣 臺南縣 南投縣 臺東縣。
屏東縣 全臺最高下雨量，***2500多毫米。
高雄縣 莫拉克臺風為高雄市山區帶來超過2,500毫米的驚人雨量，
壹年份的雨量集中在三天內落下，
臺南縣 八八水災為臺南70年來最嚴重的水患。
莫拉克帶來的雨量使得原先缺水的曾文水庫短時間內超過負荷。
南投縣 南投縣則以信義鄉山區累積總雨量最大，
全縣列為紅色警戒的土石流潛勢溪流及村落，全部集中在信義鄉。
臺東縣 臺東縣受災區集中在縣南部。受災區域涵蓋知本、太麻裏鄉、金峰鄉、達仁鄉、大武鄉等，這幾個地方都有多處民宅遭沖毀，對外道路及通訊皆被水勢影響中斷。
附註：雨量紀錄
2009年8月8日至9日，臺灣受莫拉克臺風影響，
嘉義及高屏山區自動雨量站8日單日累積雨量破千，
氣象站中臺南8日雨量523.5毫米及玉山9日709.2毫米，
均創下該站單日降雨的最大紀錄；阿裏山站在8日降下1161.5毫米，
9日更降下1165.5毫米。屏東尾寮山1403.0mm，
創臺灣所有氣象站中單日最大雨量紀錄。