工程審計是依據國家《審計法》等相關規定，對工程概、預算在執行中是否超支，有無隱匿資金、截留基建收和投資包幹結余，以及有無以投資包幹結余的名義私分基建投資的違紀行為等。審計是以基建項目為標的，以會計師、審計師為主要從業人員。
工程審計包括兩大類型：工程造價審計和竣工財務決算審計 造價審計壹般是對單項、單位工程的造價進行審核，其審計過程與乙方的決算編制過程基本相同，即按照工程量套定額。這由造價工程師完成。
對於建設單位來說，由於造價審計只是審核單項、單位工程的合同造價，壹個建設項目的總的支出是由很多單項、單位工程組成的，而且還有很多支出比如前期開發費用、工程管理雜費等是不需要造價審計的，所以還要有壹個竣工財務決算審計，就是將造價工程師審定的，和未經造價工程師審核的所有支出加在壹起，審查其是否有不合理支出，是否有擠占建設成本和計劃外建設項目的現象等，來確定壹個建設項目的總的造價。這由註冊會計師完成