行政體制：項目到期不批視為同意
方案提出，對仍需審批的項目，規定審批時限，到期不批復視為同意。同時，建立廉潔年金制度，公職人員未犯重大錯誤或未發現腐敗行為的退休後方可領取。
壟斷改革：“破壟斷”範圍廣
方案提出，以打破壟斷、促進競爭、重塑監管為重點，加快基礎產業領域改革。改革涉及電力、石油、天然氣、鐵路、電信等多方面的壟斷問題，包括輸配電分離、油價不再由政府直接規定、成立幹線鐵路公司、重組電信企業等。
土地改革：農村集體土地可平等入市
方案提出，以權利平等、放開準入、公平分享為重點，深化土地制度改革。構建平等進入、公平交易的土地市場，即在規劃和用途管制下，允許農村集體土地與國有土地平等進入非農用地市場，形成權利平等、規則統壹的公開交易平臺，建立統壹土地市場下的地價體系。針對市場上較為棘手的“小產權房”，方案提出，在集體建設用地入市交易的架構下，對已經形成的“小產權房”，按照不同情況補繳壹定數量的土地出讓收入，妥善解決這壹歷史遺留問題。此外，將土地稅收計征重點從流轉環節轉向保有環節，實施從價計征的新征稅原則。
金融改革：降低金融業準入門檻
方案明確以降低金融行業準入門檻、推進利率匯率市場化為重點，推動金融體系改革。應當抓住全球經濟再平衡的有利時機，建立壹個市場導向、高效而富有彈性的金融體系，支持轉型升級和城鎮化進程；化解潛在金融風險；與財稅體制和要素價格改革等相配合，形成協同效應。方案還首先提出了要“降低金融行業準入門檻”，主要是形成多元化競爭性的金融體系，滿足實體經濟的金融服務需要。大幅降低各級政府對金融機構的持股比例，通過金股等國際通行的股權形式和有效監管，體現國家對金融機構的控制力。在城市商業銀行等區域性金融機構經營狀況總體穩定的情況下，及早推進並購重組和股權多元化，以控制和化解風險隱患。同時，推進利率市場化進程、匯率形成機制市場化和人民幣資本項目可兌換等。
財稅改革：財權事權均向中央傾斜
針對當前中央和地方政府財權和事權不匹配的問題，方案提出，將基礎養老金、司法體系、食品藥品安全、邊防、海域、跨地區流域管理等劃為中央事權。按事權優先原則，進壹步調整優化稅收劃分和轉移支付制度。對於“營改增”後缺乏主體稅種的地方政府，方案提出，積極推進以房產稅和消費稅為主的地方主體稅建設。擴大房產稅試點範圍，盡快完善相關制度，壹定過渡期後全面推開，並明確為區縣級政府主體稅。按照消費地原則將國內消費稅劃為地方稅，由生產環節改為零售環節征收，同時將車輛購置稅劃歸地方稅。另外，方案首次提出實施“國民基礎社會保障包”制度。起步階段該保障包的內容可包括：基本養老保險基金實行全國統籌、醫保參保補貼實現費隨人走、對全國低保對象按人頭實行均壹定額補貼。
國資管理：重定國資公***服務職能
方案明確，國有資產具有以下四項基本職能：社會保障職能，提供非盈利性公***服務職能，促進戰略性產業穩定、競爭和創新的職能，保障國家安全的職能。參照新加坡淡馬錫資產管理公司模式，與上述國有資產職能分類相對應，通過劃撥現有國有企業股權，建立壹批國有資本投資運營基金。
創新和環保：以企業和市場化為主
方案提出，企業為主體的創新是實現我國經濟轉型的基礎。要寬容對待在信息通信、電子商務、新能源、電動汽車、金融等領域出現的新業態、新技術、新商業模式，為創新留出足夠空間和時間。並且改革以項目直接撥款為主的科技經費支持方式，建立以基金等金融手段支持研發和產業化的財政支持機制。另外，方案提出，引入市場化的生態環保促進機制，實行更嚴格的環保制度，其中包括：建立地區減排合作機制和各種排汙權交易制度，形成市場化的減排激勵；逐步提高礦產開發的環境補償標準，實現環境成本內部化等。
涉外經濟：建高質量國際自貿區
打造對高端產業與生產要素具有更強吸引力的投資環境。改革外資審批體制，開展準入前國民待遇與“非禁即入”的試點；統壹內外資法律，強化法律法規的壹致執行，形成各類所有制企業平等有序競爭的市場環境。加快外貿體制改革，增強高附加值出口競爭力。以中日韓自貿區為重點，加快談判建立高質量的自由貿易區。