全國會員代表大會是中國安全生產協會的最高權力機構。理事會是大會的執行機構，常務理事會行使理事會閉會期間的職責。
中國安全生產協會理事、常務理事、副會長、會長以及秘書長經全國會員代表大會選舉產生。理事會主要由大型國有生產經營單位、知名科研院所、大專院校、相關團體、行業管理組織的會員代表組成。理事會每屆任期4年。
中國安全生產協會設有教育培訓、安全評價和註冊安全工程師等3個工作委員會；設有煤礦安全、金屬非金屬礦山安全、冶金安全、勞動防護、危險化學品安全和煙花爆竹安全等6個專業委員會。
秘書處是中國安全生產協會的常設辦事機構，由秘書長主持日常工作，下設綜合管理部、組織聯絡部、宣傳教育部、技術服務部和安全標準化辦公室等業務部門。