區別如下：
第壹：私往來香港或澳門地區旅遊、探親、從事商務、培訓、就業、留學等非公務活動的旅行證件
第二：簽註是印於港澳通信證上的，證明通行證持有人可合法前往香港或澳門的註釋。簽註會註明持有人此次前往香港或澳門的目的、行程時間等。
第三：內地居民往來港澳簽註分為6個種類，即個人旅遊（G）、探親（T）、商務（S）、團隊旅遊（L）、其他（Q）、逗留（D）根據申請事由分類簽發。其中香港G簽和L簽的有效期都為：3個月1次、3個月2次、1年1次、1年2次四種有效簽註。澳門簽註只有3個月1次、1年1次申請。簽註規定每次在香港或者澳門逗留不超過7天，壹進壹出算壹次。
第四：港澳通行證是壹個類似護照的藍黑色封皮的證件簿，其有效期是五年。如下：
而簽註是印於該通行證內頁的幾行文字註解，每申請壹次簽註，就會有壹行註解。簽註的有效期就是持有人此次可以逗留香港或澳門的總時間。如下：
擴展資料
首次辦理須本人至戶籍所在地的出入境管理處提交申請，申請材料有:居民身份證及復印件(用A4紙復印，可復印在同壹張紙上)以及填寫《中國公民出入境證件申請表》，2寸淡底色彩照2張(也可現場拍照，費用自付)，同時分別申請赴香港、澳門的簽註。
只去香港則申請香港簽註，只去澳門則申請澳門簽註，如果香港、澳門都去，則兩地簽註都要申請。
辦理時限自受理之日起10個工作日(首次或非首次申請)。但均不含郵遞日(壹般在五天左右)以及節假日。
費用《往來港澳通行證》每本80元;壹次往來簽註，每個15元，二次往來簽註，每個30元。
參考資料：