1、全日制學術學位研究生學費為8000元/年，全日制專業學位研究生學費為10000元/年，其中會計碩士學費為20000元/年、藝術碩士學費為12000元/年。
2、非全日制碩士收費標準與全日制碩士收費標準基本壹致，其中法律碩士學費為15000元/年·生、臨床醫學學費為10000元/年、工商管理碩士學費為30000元/年、公***管理碩士學費為20000元/年、會計碩士學費為30000元/年、工程管理碩士學費為20000元/年。
獎助體系如下所示：
1、學業獎學金：每生均9000元/年，壹等學業獎學金12000元/年；
2、國家助學金（有固定收入者除外）：6000元/年；
3、國家獎學金：20000元/次
此外，揚州大學還設有校長特別獎學金、社會獎學金，以及“三助壹輔”崗位津貼等，具體獎助政策請咨詢院校研究生工作部。