三者的區別如下：
1、變異範圍不同
①基因突變是在DNA分子水平上的變異，只涉及基因中壹個或幾個堿基的改變，這種變化在光學顯微鏡下觀察不到。
②染色體變異是在細胞水平上的變異，涉及染色體的某壹片段的改變，這壹片段可能含有若幹個基因，這種變化在光學顯微鏡下可觀察到。
③基因重組是原有基因的重新組合，並沒有產生新基因，而是產生了新的基因型。
2、變異的方式不同
①基因突變包括基因中堿基對的增添、缺失和替換三種類型。
②染色體結構變異包括染色體片段的缺失、重復、倒位和易位。
③基因重組是通過控制不同性狀的基因重新組合。
3、變異的結果不同
①基因突變引起基因結構的改變，基因數目未變，生物的性狀不壹定改變。
②染色體結構變異引起排列在染色體上的基因的數目和排列順序發生改變，生物的性狀發生改變。
③基因重組產生了新的基因型，但不可以產生新的基因和新的形狀。
4、發生時期不同
①基因突變主要發生在細胞分裂間期。
②基因重組主要發生在減數第壹次分裂四分體時期和後期。
③染色體變異沒有固定發生時期。
擴展資料：
三者的聯系：
1、三者均屬於可遺傳變異，都為生物的進化提供了原材料。
2、基因突變產生的新基因，為生物進化提供了最初始的原材料，是生物變異的根本來源，基因突變為了基因重組提供了大量的可自由組合的新基因，基因突變是基因重組的基礎。
3、基因重組的變異頻率高，為進化提供了廣泛的選擇材料，是形成生物多樣性的重要原因之壹。
4、基因重組的基因變異均產生新的基因型，也可能會因此產生新的表現型。
參考資料：