原農業部的四大水產學院是：上海水產學院、大連水產學院、廈門水產學院、湛江水產學院。
1、上海水產大學
上海水產學院，為中國第壹所本科建制的高等水產學府。1972年，更名為廈門水產學院，後停辦，1979年，學校在上海復校，1985年11月，經農牧漁業部批準，更名為上海水產大學，隸屬農牧漁業部。 2008年，上海水產大學更名為上海海洋大學。
2.大連水產學院
大連水產學院學校創建於1952年，前身為東北水產技術學校，1958年升格為大連水產專科學校，1978年升格為大連水產學院。2000年由農業部劃轉遼寧省管理。2010年經教育部批準更名為大連海洋大學。
3、廈門水產學院
廈門水產學院系1972年上海水產學院南遷廈門而成立。1979年，恢復上海水產學院和續辦廈門水產學院，學院壹分為二，兩院於1979年12月起，各自獨立辦學。1994年10月，集美學村原五所高校合並成立集美大學，農業部所屬的廈門水產學院也並入集美大學，現為集美大學水產學院。
4、湛江水產學院
湛江水產學院前身是創建於1935年的廣東省立高級水產職業學校。她是廣東現代海洋水產教育的發端，幾經遷徙之後升格發展成農業部直屬的湛江水產學院。1997年1月，湛江水產學院和湛江農業專科學校實質性合並組建湛江海洋大學。2005年6月，經教育部批準，更名為廣東海洋大學。