山東農業大學王牌優勢專業有：動物科學專業、農學專業、園藝專業。
1、動物科學專業：
動物科學是普通高等學校本科專業，屬於動物生產類專業，學制四年，授予農學學士學位，專業代碼090301。
該專業培養具備動物遺傳育種、動物繁殖、動物營養與飼料科學、家畜環境衛生與牧場設計、畜牧場經營管理以及畜、禽等動物生產方面的知識和技能，能在相關部門和企事業單位從事教學、科學研究、生產與管理等方面的動物科學類應用型、復合型或創新型人才。
2、農學專業：
農學是普通高等學校本科專業，屬於植物生產類專業，學制四年，授予農學學士學位，專業代碼090101。
該專業培養具備堅實的生物科學、作物生產、作物遺傳育種及種子生產與經營管理等方面知識，具備開展與農學有關的教學、科研、技術設計、推廣開發、經營管理等方面的工作能力，具有健全人格及社會責任感，有創新、創造和敬業精神的農學學科復合型人才。
3、園藝專業：
園藝是普通高等學校本科專業，屬於植物生產類專業，學制四年，授予農學學士學位，專業代碼090102。
該專業培養具備較完整的現代生物科學的知識體系和較寬厚的園藝基本理論知識，掌握較紮實而熟練的基本技能，能在果樹、蔬菜、觀賞園藝、設施園藝、園林綠化及其他相關領域從事現代園藝生產、科技推廣、產業開發、經營管理及教學和科研等方面工作。
有較寬廣的適應性和壹定專業特長的園藝學學科復合型人才；可從事植物栽培、品種選育、果蔬育種、栽培耕作、選育繁育等相關崗位，例如林業技術人員、園林/景觀設計、遺傳育種栽培技術人員、土壤肥料技術人員、科研人員、園藝師等。