1999年，延邊教育出版社抓住延邊州文化事業單位改革試點的機遇，大膽推行“壹社兩制”的改革。“壹社兩制”就是把出版社業務進行分離，出版社作為母體仍然保持事業體制不變，其主要任務是集中精力抓好朝鮮文教材出版，確保“課前到書，人手壹冊”等公益性出版任務順利完成。同時，出版社將經營性的漢文圖書策劃與營銷、廣告設計、激光照排、發行儲運等業務從母體中剝離出來，組建公司。新組建的公司徹底擺脫事業單位的管理模式，完全按公司制模式運營。
為了占據全國出版市場的制高點，延邊教育出版社於2001年在京設立公司並選派出版社的中堅力量到京工作，同時在北京招聘了壹批在教輔研究和開發領域頗有經驗的高級專業人才，在短時間內打開局面，策劃、出版了《新課標教案》、《教材精析精練》、《壹課3練》、《同步練習》、《課時詳解隨堂通》等系列品牌教輔。這些教輔在中國 27個省市自治區發行，頗受讀者青睞，創造了不俗的銷售業績。“壹社兩制”為發展民族教育出版和保證出版社實現跨越式發展在體制機制上提供了強大的保障和支持。