舉例而言，如果第壹誌願裏設有A、B、C、D四個平行校誌願，考生依次填報後，錄取時首先將考生檔案投到考生填報的A學校，如成績不夠，則將考生檔案投到B學校。若符合B院校的投檔條件，就不再向C和D院校投檔。在這個過程中，考生不會因為將B學校放在了自己誌願填報的第二位置而受到B學校的“歧視”，而是和其他在第壹位置填報B學校的考生壹樣競爭，達到投檔線就可以順利投檔，這就是與第二誌願的最大區別所在。依次類推，只要被檢索的院校中出現符合投檔條件的院校，即向該校投檔。檔案投出則完成該考生的投檔過程，投檔後由院校決定錄取與否。
2008年教育部在安徽省、湖南省、江蘇省、遼寧省、上海市與浙江省6個省區實行平行誌願投檔錄取模式的試點改革。壹年的實踐證明，實行平行誌願投檔錄取模式，有效降低了考生誌願填報風險。
在試點成功的基礎上，2009年教育部又新增了福建省、貴州省、海南省、河北省、吉林省、江西省、四川省、雲南省、廣西壯族自治區與寧夏回族自治區10個省區實行改革試點，平行誌願投檔錄取模式進壹步在全國推廣。
2010年廣東省實行平行誌願投檔錄取模式，2013年山東省與黑龍江省實行平行誌願投檔錄取模式，2014年遼寧省（全面）與陜西省實行平行誌願投檔錄取模式，2015年甘肅省和北京市正式實行平行誌願投檔錄取模式。