全國醫科大學排名如下：
（1）從學校名次來看，醫學類大學排名第壹名的是北京協和醫學院，第二名是在上海的海軍軍醫大學，第三名是首都醫科大學，第四名是在西安的空軍軍醫大學，第五名是哈爾濱醫科大學。
（2）從院校性質看，軍事醫學院校實力最為強勁。比如在全國醫學類大學排名中，海軍軍醫大學排名全國第二名，空軍軍醫大學排名全國第四名，陸軍軍醫大學排名全國第八名。海陸空的軍醫大學都在全國排名十名之內，可謂實力強大。
（3）從城市屬地劃分來看，北京的醫學類大學全國最強。北京擁有醫學類大學全國排名第壹名的北京協和醫學院、全國第三名的首都醫科大學和全國第四名的北京中醫藥大學。也就是說，全國醫學類大學排名前五的高校，北京占據三所！
上海的醫學類大學的實力也不錯。上海擁有醫學類大學全國排名第二名的海軍軍醫大學和排名第十壹名的上海中醫院大學。
東北的醫學類高校也實力雄厚。比如哈爾濱醫科大學在全國醫學類大學排名第五名，地址在沈陽的中國醫科大學排名全國第六名。另外，東北還有若幹所比較好的醫學類大學，包括大連醫科大學、黑龍江中醫院大學、沈陽藥科大學和遼寧中醫藥大學。
（4）從辦學層次來看，全國醫學類大學排名第壹名的北京協和醫學院的辦學層次是世界知名高水平大學。
辦學層次為世界高水平大學的醫學類大學***有四所，分別是海軍軍醫大學、空軍軍醫大學、北京中醫院大學、上海中醫藥大學。
辦學層次為中國壹流大學的醫學類大學有8所，分別是首都醫科大學、哈爾濱醫科大學、中國醫科大學、陸軍軍醫大學、中國藥科大學、南京中醫藥大學、天津中醫藥大學和廣州中醫藥大學。