1，申報方式不同。
稅務局網上申報是通過互聯網在線提交申報材料並進行電子簽名的壹種方式。紙質申報是將申報資料打印成紙質表格，填寫並簽字，然後通過郵寄或投遞的方式提交給稅務局；
2.提交的材料不壹樣。
網上申報需要稅務局提交電子相關材料，包括購房合同、借款合同、還款明細、銀行流水等。紙質申報需要提交紙質版的相關材料，包括購房合同、借款合同、還款明細、銀行流水復印件等。；
3.處理時間不同。
壹般稅務局網上申報可以實現即時申報和查詢，申報後不需要等待很長時間就可以得到申報結果。紙質申報需要通過郵寄或快遞方式提交，收到申報結果需要壹段時間。
抵押退稅申報流程:
1.準備材料:購房者需要準備個人所得稅繳納證明、購房合同、貸款合同、還款記錄等相關材料；
2.登錄網上申報系統:購房者需要登錄稅務局網上申報系統，選擇“個人所得稅”進行申報；
3.填寫申報表:根據系統提示，填寫個人所得稅申報表，包括納稅人信息、房貸信息、購房信息等。
4.上傳材料:按要求將準備好的個人所得稅完稅證明、購房合同、借款合同、還款記錄等材料上傳至系統；
5.審核繳納:稅務機關對提交的材料進行審核，審核通過的，要求購房者繳納相應的稅款；
6.稅務機關辦理:稅務機關對購房者提交的申請資料進行審核，審核通過的，將退稅款打入購房者指定的銀行賬戶。
綜上所述，不同地區的房貸退稅申報方式可能略有不同。建議您查看當地稅務局的相關規定，在具體申報時選擇合適的申報方式。
法律依據:
《中華人民共和國個人所得稅法》第十四條
扣繳義務人每月或者每次扣繳的稅款，應當在次月15日內上繳國庫，並向稅務機關報送扣繳個人所得稅申報表。
納稅人辦理退稅或者扣繳義務人為納稅人辦理退稅的，稅務機關經審核後，應當按照國庫管理的有關規定辦理退稅。