傳統病歷與電子病歷的主要差別如下：
主動的
1、傳統病歷是被動的、靜態的、孤立的，電子病歷是主動的、動態的、關聯的。傳統病歷完全不具有電子病歷的第二方面功能，即沒有主動性和智能，不能關聯相關知識。紙病歷放在那裏，可以被閱讀，也可補充新內容，但其內容與內容之間無法建立有機聯系，病歷內容與患者的實際狀態完全脫節，病歷內容與其相 電子病歷
[1]關知識沒有連接， 病歷只能完成順序不變的記載作用。電子病歷的革命性，在於其儲存的信息不再是孤立的、靜態的，而是關聯的、動態的，不再僅是塊狀信息，而是知識的集合。新補充的信息會與已存在的所有信息建立必要的聯系， 變換結構，根據現有的知識、規律、規則、先例，對患者的狀態進行綜合分析判斷，主動提示相關醫生或病人；提出檢查、治療計劃等。例如：壹個管理腎透析的電子病歷系統，可以記載患者的全部相關生理指標及既往全部透析情況等資料，這些資料在進入系統時已經被加工整理，當某位患者完成壹次透析治療後，系統會根據儀器的即刻檢測和醫生輸入的新檢查結果，綜合既往情況立即提出壹套詳細的下壹階段治療計劃或相關建議，包括是否需要增加檢查項目，是否需要輔助用藥，用藥的計量等。醫生參考系統提供的方案給出自己的方案後，電子病歷系統會根據其存儲的知識進行判斷，如果發現有矛盾或不符合壹般規律或違反特殊原則之處則提醒醫生。醫生可以詢問有哪些矛盾，其原理及文獻如何。如果醫生堅持自己的方案，予以實施，並最終證明方案有效，則電子病歷系統將學習這壹方案，並作為先例保存。由此例可見傳統病歷的記錄功能在電子病歷中只是諸多功能的壹個方面。
完整和準確
2、傳統病歷無法保證數據完整，電子病歷則可保證完整、準確、及時獲得信息資料。 傳統病歷的這種缺陷源自諸多方面。 首先，檢查、治療、監護等技術的發展，甚至於包括管理技術的發展都在否定傳統病歷。按照病案管理的初衷，所有患者相關資料最後都應集中到病案中進行統壹保管。X線片最先脫離病案而單獨管理，病理切片、塗片更是從來沒有歸入病案，CT、B超、核磁等各種成象造影檢查，圍手術監護、透析治療、康復治療等等種種檢查治療獲得的大量的信息均被保存在病案之外，進入病案的只是簡短的報告或是部分簡略的影象資料，有的除了醫囑和病程日誌外甚至什麽具體資料都沒有留到病案中，這些信息資料被分散保管在各專業部門或被丟棄。 另壹方面，由於傳統病歷紙介質條件的限制，既便有些資料，如壹段多普勒超聲錄象，希望與病案壹同保管，也是不可能的。信息系統投入使用後，醫囑等信息被存入計算機，盡管仍有打印頁裝訂到病案中，但查看紙面信息的人越來越少。綜合上述情況，從總趨勢上不難看出，通過病案保管的患者信息占患者總信息的比例正在迅速變小，在壹個不太久的未來，紙病歷必然會失去其存在意義。 其次，交通的發達，使人們的地域觀念減弱。醫療體制改革，使患者可以選擇多家醫院就診。壹個人可以在北京的東城或西城的不同醫院看病，也可能在深圳、西安的醫院看病。采用紙病歷，任何壹家醫院想全面得到其它醫院關於某個病人的病歷資料都是十分困難的。這種困難不僅限於形式，不同醫院的檢查結果、習慣用語、質控標準等，其它醫院的醫生基本上無從獲知。 電子病歷可以全面管理各種信息資料。 可以集中管理，也可以分散管理並在理論上收集完整的各種分散管理的資料。例如壹位患者做CT檢查，他在做檢查時，放射科的醫生可以即刻看到其影象，主管醫生則可以通過電子病歷系統在病房同時觀看，但此時由於放射科醫生尚未給出診斷報告，相關影象資料主要保管在放射科。當診斷做出後，相關資料通過計算機網絡自動傳入電子病案室永久保存，此時主管醫生能體會的只是內容的不同，具體資料位於何處，不需 電子病歷
要也不必關心。不同醫院的電子病歷可以通過網絡和必要的協議、標準在醫院間完成數據傳輸交換，醫生則可得到全面的資料，同樣是不必關心病歷的保存位置。
知識關聯
3、傳統病歷無法得到必要的釋義，無法進行知識關聯 所謂釋義，就是解釋含義。對於病案，釋義包括兩方面內容： 壹是不同醫院不同醫生或工作人員使用的術語或檢查儀器記錄的信息，其實際含義需要解釋，以使不同的人能夠正確獲知其準確含義。例如壹家醫院的病案在另壹家醫院中被閱讀時就需要做必要的釋義。患者或保險公司人員等非醫療人員閱讀病歷更需要隨時釋義。 二是對於由於專業、資力或新進展造成的生疏術語或新概念或新的檢查、治療項目、新藥等，需要解釋說明理論根據、含義、正常值、適應癥等等。釋義功能需要借助人工智能技術，特別是知識工程。知識關聯對於醫學實習生、進修醫及低年資醫生具有重要意義。知識關聯也利於解決由於專科細化造成的病歷閱讀困難，利於低級別醫院的醫生***享應用高級別醫院的病歷資料。這類功能紙病案完全無能為力。
及時獲取
4、傳統病歷不能保證及時獲取、不能***享 除了前述由於病案屬於不同醫院而造成的取用不便外，同壹家醫院內部也會由於病案正被借用、尚未歸檔、丟失等原因造成病歷不能及時到位。采用電子病歷則可徹底改變這壹局面，壹位患者的病歷不僅可以多人同時獲取，而且可以異地，不同醫院獲取。如果接入無線網，則醫生可在任何時候，如在旅途或在會議中，獲取病歷。