貝爾實驗室的莉蓮·施瓦茨有壹天突發奇想，在電腦上將《蒙娜麗莎》與達·芬奇的自畫像重疊，發現二者的眼睛、發際線與鼻子等輪廓竟然能夠完全重合。施瓦茨最終得出結論，《蒙娜麗莎》就是達·芬奇的自畫像。至於達·芬奇為什麽要把自己畫成壹個永恒的女性形象，壹種解釋是因為他要用這種方式隱晦地挑戰以基督教為代表的西方男性霸權。蒙娜麗莎是壹個雌雄合體，這是達·芬奇心目中人性最理想的結合方式，男人和女人平等地融合在壹起。
猜想二：達·芬奇母親說
另壹種說法是，《蒙莎麗莎》是達·芬奇為母親畫的肖像，出於某種不為人知的原因，達·芬奇沒有標明這幅畫是為母親所作，和同時代大多數畫不同的是，這幅畫上沒有簽名、沒有日期、沒有被畫者的名字。
猜想三：意大利傳奇女子說
據《泰晤士報》報道，德國藝術史學家澤斯特在研究多年後宣稱，《蒙娜麗莎》的原型其實就是意大利的傳奇女子斯福爾紮。斯福爾紮是米蘭公爵的私生女，在文藝復興時期的意大利極富傳奇色彩，有“悍婦”之稱。1462年，15歲的她嫁給了教皇西克思圖斯四世的侄兒，聘禮是弗利和伊莫拉兩座城市。她的第壹任丈夫、情人與第二任丈夫先後被殺。1500年，斯福爾紮的家族在與博爾吉亞家族的爭鬥中失敗，在城破後被囚禁壹年。被釋放8年後，斯福爾紮去世，享年46歲。
猜想四：妓女說
也有人認為蒙娜麗莎甚至不是良家女子，而是壹名妓女。那不勒斯的卡羅·維斯教授更認為，畫中的蒙娜麗莎是壹名高級妓女，達·芬奇捕捉到了壹名職業誘惑者的微笑。