目前，人事檔案管理存在交接程序不完善、管理手段落後、硬件設施有限、無紙化職稱評審與傳統人事檔案管理方式沖突、檔案材料範圍狹窄等問題。隨著我國人事制度改革的深入，人事檔案管理中存在的諸多問題亟待解決，以提高人事檔案的利用水平。
壹、材料的收集和歸檔
就人事檔案管理而言，材料的收集是做好人事檔案管理的關鍵和前提。材料的收集是否完整，內容能否反映幹部職工的整體情況，將直接影響檔案的提供和利用。因此，人事檔案管理人員要在材料的收集上下功夫，特別是要註重收集反映幹部德、能、勤、績的材料。
主要應做好以下工作:
1，及時收集整理歸檔。檔案員應對收集的材料(如人事任免、加薪升級、考核、獎懲等)進行登記。)或材料(如學籍、學歷、技術職稱等。)由相關部門及時傳遞並歸入人事檔案中相應的類別。
2.加強與相關部門的聯系。組織人事部門應與形成人事檔案的部門建立人事檔案收發聯系制度。檔案工作人員應根據形成人事檔案的信息，定期向有關部門(各級人事組織、紀檢監察、教育培訓、審計、統戰等部門)收集或匯總新形成的人事檔案。
3、嚴格控制材料的“入口”，做好標識工作。人事檔案管理要求收集完整的材料，但並不是所有收集的材料都歸檔。因此，對收集到的材料要認真鑒別，嚴格審查。對不符合備案要求的材料，應及時通知形成材料的部門進行補正或辦理手續；不屬於人事檔案範疇的材料必須丟棄。
第二，對文件種類和卷內種類的判斷。
1，文件類型的判斷。歸檔前，檔案人員首先要判斷收集的材料是否屬於人事檔案，註意不要把屬於文書檔案的材料(如幹部任免通知、請示、函件等。)、紀檢檔案(如請示、調查報告、旁證、控告材料等。)、業務檔案(如個人作品、論文、翻譯、發明概述等。)和其他類型的文件。
2.對卷內類別的判斷。人事檔案中材料的分類壹般可以根據材料的名稱歸入相應的類別。但也有例外，有些資料的名稱與內容不壹致，如果按名稱分類，可能會給以後的使用帶來不便。所以分類的時候，壹定要看名字，也要看內容；對於包含很多方面的，要看哪個方面的內容是主要的，爭取分類準確。
第三，關於保管檔案的方式
人事檔案管理有兩種常見的方式，裝袋和裝訂。兩種方法各有利弊。裝袋法由於材料直接裝袋，不裝訂，方便取料和填料，但不符合“裝訂整齊”的要求，容易丟失材料。裝訂方法是將材料分類，按順序裝訂在壹起，放入檔案盒中存放。它的優點是裝訂整齊，外觀美觀，但查閱資料不方便，而且容易因為反復拆封而損壞紙張。
人事檔案是人才信息的重要載體，能夠全面反映個人經歷、德才表現、獎懲情況、行為軌跡、歷史背景和經歷，是知人善任、選拔人才的重要工具。做好人事檔案管理對人力資源開發具有重要作用。隨著我國人事制度改革的不斷加強，企事業單位的人事檔案管理更加重要。