（1） 結構化數據的錄入。
① 結構化數據輸入的基本條件
病例中大量的信息可由醫護人員直接進行結構化數據輸入,而結構化數據輸入的基本條件是結構化的系統模型、知識驅動性內容、預定義詞匯表、合成表達式規則。
②結構化數據錄入方法
（2） 自然語言數據的錄入。（NLP）
NLP的優點是醫師在書寫病例時不必改變他們習慣的記錄方式，可以自由地表達各種信息。他們可以用手寫文本或磁帶錄音。對於錄音，NLP系統可以利用語音識別系統來分析自然語言中句子，處理其中包含的醫學信息，從而進行數據的錄入。NLP最基本的功能是對所用術語產生索引，這些索引可以提取含壹個或多和指定術語的文本，NLP將可以將它們聯系起來處理，進行推論。
（3）生物信號和醫學圖像處理
隨著醫院引進大批數字化的儀器設備，應用LIS、PACS等醫學信息系統，生物信號和醫學圖象經它們處理，已逐步實現數字化，並可通過系統的接口，把這些數字化的醫學信息整合到電子病歷中。
不同系統之間信息的傳遞是通過系統的接口，信息標準化是接口的關鍵。當兩個系統使用同壹個標準時，傳遞信息就非常簡單。如兩個系統使用的不是同壹個標準時，接口就必須進行信息轉換，由發送信息的系統通過接口將數據轉換成接受信息的系統可以理解的格式，或者由接收系統通過接口將數據轉換成可以理解的格式。信息的標準化是壹個漸進的過程，為了便於使用非標準信息的系統之間接口，人們開發了接口引擎，利用接口引擎將非標準化信息轉換為標準化信息。
（4）電子病歷的簽名與更改
病歷是具有法律效應的文件，病歷數據具有法律證據作用。病歷中醫療數據的安全性極其重要，這不僅維護了患者的利益，也維護了醫療人員的利益。每次寫完電子病歷都要進行簽名後才能生效。如果重新打開電子病歷進行更改操作，EPR系統就會針對不同的更改人進行不同的處理，如上壹級醫師對病歷內容進行刪除或增加內容時，系統自動將刪除的內容變紅且在文字中間加壹條橫線；如果是主任醫師對病歷內容進行刪除或增加內容時，系統自動將刪除的內容變紅且在文字中間加兩條橫線，對新加的內容變紅且在文字下面加兩條橫線。