（2001）
該劇場景取材開始於永樂町的東京寶冢劇場正在興建的工地為題材.電梯的纜線斷裂的爆破場面、配電室的破壞所引發的停電、切換自己發電等等……壯觀場面為創作構想是第5彈的重點。劇場屋頂、觀眾席上方的興建工程，地下停車場…等等都是取景的所在地。 這次少年探偵団的戲份很多唷，少年偵探隊的大活躍呢!黑暗組織也隆重登場，當然啦，反派就是黑暗組織。請大家拭目以待 。
青山老師將會在原作配合第五彈電影劇情，再次讓黑暗組織出場，再讓電影劇情銜接。這是繼青山老師在漫畫中讓KID下戰帖，幫忙為「世紀末的魔術師」下伏筆之後，第二次幫電影銜接劇情。
終於那些家夥全員出動，看不見出口的殺人遊戲，現在，終於開始…… 危險的陷阱讓時間陷入停止。 那些黑衣人的背後擁有兇惡的陰謀，這些家夥目的到底為何 以地面上300公尺的摩天大樓為死亡舞臺，魔鬼般的手正在暗處悄悄伸向柯南！……
主題曲：always
9.水平線上的陰謀
主題曲：等待夏日歸航的帆 ZARD
（2005）
除了故事本身的不同，第九部劇場版的制作相當出彩，由於故事的場景設定在壹艘豪華遊輪上，這就為畫面的表現提供了很大的發揮空間，制作以後的效果也確實配得上這樣的背景，甚至影片上映前就有宣傳拿“泰坦尼克號”來相比了，雖說有些誇大，但未嘗不是壹個方面。實際比較柯南歷次劇場版以後，可以發現本片的場面還算是比較的恢宏奪目，理應屬於九部劇場版之中的上乘之制作。可以說這是壹部仿效好萊塢電影豪華場面的動畫片，特別是結尾驚心動魄的場景設置，聲畫視聽完全是壹幅動作片的手法，那麽不僅僅只局限於柯南迷們，所有喜歡動畫片的觀眾，似乎都適合看壹看這部電影。當然，對於柯南迷們而言，本片應該沒有讓他們失望，但是也沒有什麽新鮮的味道，只是華麗場面的增加而已。PS：毛利小五郎這次可是有勇有謀、文武雙全。
15年前的壹個霧色濃稠的夜晚，在北大西洋的海上壹艘正在航行中的貨輪“第壹八代丸”，撞上了前方巨大冰川發生事故沈沒。萬幸的是船上大部分人都逃過這壹劫難，只有船長和壹名船上的高級幹部不幸罹難身亡。
時間回到15年後的現在，地點是日本東京西多摩市的別墅密集區，八代財團旗下分屬八代造成業的設計師八代英人，開車的時候心臟病突發，結果車子不幸掉下山崖造成車毀人亡。誰也沒想到，時隔15年且分別發生在海洋和陸地上的兩起事故，會是壹項重大陰謀的開始。
鏡頭轉到正在太平洋上航行的豪華客輪阿弗蘿蒂特號上，這是根據希臘神話中愛與美的女神阿弗蘿蒂特的名字命名的。柯南、小蘭和毛利小五郎受到園子邀請，參加這首船的處女航。理所當然，這麽受到矚目的豪華客輪，參加處女航的都是些政界、社交界的紳士名媛。
然而沒多久，船上出現了可疑分子，園子更遭到襲擊被其監禁，幸運的是根據柯南的推理順利找回了園子，正在眾人歡欣鼓舞的時候，卻發生了殺人案件。被害者正是這次處女航的主辦人，八代客輪的社長八代貴江，她是半個月以前車禍身亡的八代英人的妻子，緊接著八代財團的董事長，貴江的父親八代延太郎也從船上神秘消失……
獲悉此事的目暮警官帶著壹群警察上船來搜查，同時出動了東京海上保安廳的人對海上進行搜查，陸地上也有警視廳的人在八代英人出事的地點進行再搜查。與此同時，理所當然地我們的小主人公柯南也展開了他最擅長的推理。而這次包括乘客和船上工作人員，總***有600名嫌疑人。於是柯南、毛利小五郎以及警方分別展開了各自的調查，與此同時，犯人也正展開他巨大的陰謀。
為了不影響乘客的情緒，船上的晚宴仍然如期舉辦。在柯南的努力下，真相即將被揭發時卻突然發生了重大意外——油輪的機房發生了大爆炸！犯人更在整艘油輪的主要機房內都安置了炸彈，整個船身不停搖晃，讓船員和乘客都驚恐萬分，全船600條人命，就懸於瘋狂的犯人壹念之間。
置身於無處可逃的大海上，引起了極大的恐慌和混亂，人們陷入了極度的不安中。更糟糕的是，這次連小蘭也被卷入了危險裏面——當然，本片的結果，依舊是正義戰勝邪惡，柯南用他名偵探的推理救出了小蘭，不過出人意料的是，這次掌握事件關鍵的，卻是新壹和小蘭超越了時間的羈絆。
3.世紀末的魔術師
（1999）
日本名：世紀末の魔術師
英文名：the last wizard of the century
主要內容:柯南最強的對手－－“怪盜KID”再次登場，這次是竊取壹顆羅曼諾夫王朝的皇室秘寶“回憶之蛋”。同時,小蘭也開始懷疑柯南與新壹的關系，名偵探——江戶川柯南，終於要面對他生平最大的危機，也是史上最難解的謎團！透過彩蛋，可以看到俄國沙皇尼古拉二世的全家福，很感人的畫面。
而這彩蛋也引來了殺身之禍。
在制作此劇時，工作人員為了貫徹柯南系列所特有的那種寫實場景風格，拍攝了大量的實景照片，取景地點從大阪到橫須賀，範圍大到豪華客輪小到民宿民宅，連步美所住的那棟豪華住宅，就是取景於青山剛昌本人所居住的高級住宅樓。本片中的登場人物非常之多，幾乎柯南系列中的所有人物都出現了，尤其是慣偷KID常常變裝，在眾人的眼皮下以多種形象出現，但因為故事情節的巧妙編排，所以看起來並無雜亂無章之感，反而顯得更加的跌宕起伏，曲折動人。
看點
1毛利小五郎雖說還是和往常壹樣，對於暗號（本集中KID發出的預告函）做出發育不良的推理，但柯南的推理與後來在城堡中暗號的精彩解密，都很值得關註．
2KID在開場時被殺手槍襲,生死未蔔,以及出乎意料的便裝,對於怪盜迷來說的確是不可錯過的精彩鏡頭.
3KID與柯南之間的微妙關系．兩人可以說是天敵，但兩人父輩是至交，包括到影片末尾KID解救柯南，都為這位天才大盜與天才偵探的“愛情”蒙上壹層白紗。（本句參考《黃昏之館》中KID的壹句話。）
4蘭對柯南身份的懷疑．這也是本集的壹條線索
羅曼諾夫王朝的皇室秘寶－回憶彩蛋，將在大阪鈴木財團美術館內展出的同時，怪盜KID寄出「犯案預告信」準備奪取這無價的皇家藝術之寶，於是鈴木會長要求小五郎協助警方偵查，以防彩蛋被竊取。柯南壹行人來到大阪，遇到服部平次，便壹同偵查此案。在美術館遇到了蘇聯大使館的書記、珠寶美術商、羅馬王朝研究家、職業攝影師等人。看完彩蛋，大家便解讀預告信線索，不料將時間、地點都解讀錯誤。而KID竊聽到彩蛋被轉移了。在疏於防備的情況下，KID 成功地找到了回憶彩蛋。雖然柯南已經發現了KID的行動，看還是晚了壹步。KID在逃離途中，卻被神秘的殺手狙擊，墜海失蹤，生死不明。柯南以新型滑板追蹤，奪回彩蛋。與此同時從國外回來的香阪夏美小姐，從祖母的遺物中發現彩蛋的原稿圖與實物不同。
柯南看了原稿後，認為彩蛋有兩顆，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所蓋的城堡，所以大夥兒及對彩蛋虎視眈眈的研究者決議要去此城探索 ，找尋第二顆彩蛋。在返回東京的船上，攝影師寒川被殺，而且和KID相同是被擊中右眼。木暮帶著白鳥趕到，調查後柯南發現兇手可能是職業殺手史考兵。而白鳥卻幾次揭穿柯南的提示，使小蘭對柯南的身份起了懷疑。
到達東京後，大家前往城堡，阿笠博士為了送做給柯南強化的眼鏡，與灰原哀 也壹同出發至城堡，不料少年偵探團也藏身在車上跟蹤而行。在城堡中，柯南意外發現通往地下室的通道，在秘道中珠寶商乾被殺。而其他人在壹個棺木中發現了第二個蛋，並明白了回憶之卵的真正含義。
但專門狙擊人右眼的神秘殺手「史考兵」也在人群之中…… 他再次行動，目標是小五郎和小蘭，刺殺失敗後兇手搶走了彩蛋，並想燒毀城堡。柯南追趕兇手，在熊熊大火中，兇手露出了她的真面目……柯南在白鳥的幫助下逃出了火海。回家後小蘭對柯南(新壹)的真實身份再次起了疑問，正當柯南要說出真相時，“新壹”出現了……
釋題
KID的預告以“世紀末的魔術師”署名，暗合20世紀末的播出時間。其實指的是彩蛋的制作者，1900年的事了
大看點
⑴KID的登場，而且還認出了柯南的身份。⑵最後還有新壹的出現，雖然是假的，但仍很興奮
小看點
1、KID的閃亮登場（幸福的步美）
2、哀第壹次在劇場版中的亮相哦，聲優也超好聽
3、KID的預告函，還有可愛的簽名
4、在警官說即使讓怪盜基德逃走也要保護好“回憶之卵”後，中森警官壹把搶過話筒，大放厥詞“我們怎麽可以如此輕易的放過他！復活節之卵算什麽！知道嗎，各位，賭上我們警察的威信和驕傲，壹定要把那個混蛋小偷投進監獄！絕對，絕對要做到！”眾警察怒吼（熱血沸騰），小五郎很無奈。
5、追擊KID的壹幕（服部莫名其妙就掛了，原來是走走場子的，汗）
6、“白鳥”說“毛利先生就是死神吧”。KID還真是……
7、柯南打電話時“白鳥”的眼神
8、找蛋的神奇經歷（恕我找不到更好的詞）和那個蛋被投射出來的照片（超華麗麗）
9、柯南撲向蘭的那壹瞬，帥啊
10、美女史考兵射擊柯南的眼睛（鏡）
11、被大火吞噬的城堡外眾人擔心地叫“柯南”、“新壹”，然後看到柯南就在身後
12、基德扮成白鳥的樣子，還真是....
13、柯南取下眼鏡差點“招供”時KID扮成新壹出現在蘭的面前那壹大段
14、KID滿身的鴿子
15、片子最後那條毛巾的下場（無語......）
附1
此部劇場版更奠定了白鳥人民公敵的地位。唯壹帥的時候是KID扮的，之後居然還因為KID的功勞升官了。不爽關於毛利的丟臉問題：走出城堡的時候不僅傻傻的，還被哀說“跟著我就行了嘛”，那個衰樣。最後居然說“有雙美腿的青蘭小姐怎麽會是史考兵？”倒……
附2
死亡人數：2
死者名字：寒川龍 乾將壹
推理人：柯南
使用的道具：足球 基德的紙牌
動機：奪取“回憶之卵”是因為她認為皇帝的遺物應該留給和皇帝友好的祖先；殺死寒川是因為她認為寒川拍到了祖先的照片；殺乾先生是因為乾看到她裝消音器；射毛利是因為他對祖先有所侮辱。堅持射人右眼是因為祖先被人挖去了右眼（又壹個完美主義者），不過就因為這樣，我們的柯南逃過了壹死。想想要是她隨便開壹槍，柯南還有命嗎 ？
精彩句子 KID：Ladies and gentlemen,精彩的表演秀就要開始了
KID：這世上有些事，最好讓它永遠成謎……
蘭：那時的柯南，真的好帥啊，好像新壹啊，可是妳們不是壹個人吧？
怪盜基德預告函 內容
從黃昏的獅子到拂曉的少女，沒有秒針的時鐘刻下第12個字，從發光的天之樓閣降臨，收下回憶之卵
——世紀末的魔術師·怪盜基德
ONE 發行日期：1999年6月9日
歌手：B'z
作詞：稲葉浩誌
作曲：松本孝弘
編曲：松本孝弘、稲葉浩誌
靜かすぎる夜だ 耳がうずくほど
仆も君も誰も 眠ってなんかいないのに
言葉がまだ 大切なこと
伝えられるなら また 何でもいいから 聲を聞かせてよ
わかってるって もう行きたいんだろう
気づかないわけないだろう you're the only one
どんなことでも 無駄にはならない
仆らは何かを あきらめるわけじゃない
夜明けの瞬間は いつだって退屈だったけれど
いつもと違う太陽が 部屋のかたすみ照らした
夢があるなら 追いかければいい
まるでジプシーみたいに 自由にさまよいながら
仆ら出會ったんだから
また 會いましょう いつかどこかで
忘れるわけないだろう you're the only one
ドアを開ければ 道は眠って
踏みだされる壹歩を 待ちこがれている
愉快な時だけ 思い出して
涙におぼれる たまにはそれもいい
ともに過ごした日々は 仆らを
強くしてくれるよ この胸をはろう
ぜったい會いましょう いつかどこかで
忘れるわけないだろう baby, you're the only one
陽がまた升ってゆく
shizuka sugiru yoru da mimi ga uzuku hodo
boku mo kimi mo dare mo nemutte nanka inai no ni
kotoba ga mada taisetsu na koto
tsutaerareru nara mata nan demo ii kara koe o kikasete yo
wakatterutte mou ikitain darou
kizukanai wake nai darou you're the only one
donna koto demo muda ni wa naranai
bokura wa nani ka o akirameru wake janai
yoake no shunkan wa itsu datte taikutsu datta keredo
itsumo to chigau taiyou ga heya no katasumi terashita
yume ga aru nara oikakereba ii
marude JIPUSHII mitai ni jiyuu ni samayoi nagara
bokura deattan dakara
mata aimashou itsuka doko ka de
wasureru wake nai darou you're the only one
DOA o akereba michi wa nemutte
fumidasareru ippo o machikogarete iru
yukai na toki dake omoi dashite
namida ni oboreru tamani wa sore mo ii
tomo ni sugoshita hibi wa bokura o
tsuyoku shite kureru yo kono mune o harou
zettai aimashou itsuka doko ka de
wasureru wake nai darou baby, you're the only one
hi ga mata nobotte yuku