基本過程如下：
1、將apk解包成壹個文件夾
2、修改AndroidManifest.xml中對應的包名
3、修改smali目錄下中的包
4、將文件夾打包成apk
5、將apk重新簽名
6、驗證apk的簽名
7、優化apk
8、安裝apk，並測試
基本前提條件：
1、java的環境
2、Eclipse及android的開發環境(這個主要是用來進行調試)
3、text文本編輯器，本人用的是UEdit，也可以用類似的，主要是利用其查找及替換功能
這篇文章主要用來反編譯apk得到源碼，但google進行了反制，只能得到壹些可讀性不高的源碼，這裏主要是利用反編譯apk生成程序的源代碼和圖片、XML配置、語言資源等文件.
參考文獻裏提到的apktool-1.0.0.tar.bz2和apktool-install-windows-2.1_r01-1.zip均可以從/p/android-apktool/上下載，下載好之後，將涉及的命令行目錄及exe目錄添加到電腦的path路徑中，這樣就便於操作了，如檢測apktool是否可以，可以在命令行中輸入apktool，如果可以識別就表示OK了。
參考了國內的技術文章後，有人發帖以上面的思路進行操作，但沒有發技術文章，所以筆者只能去國外論壇中逛逛了，在Stack Overflow中，找到了相關的帖子，有老外留言"you can't do this"，這個的確有違技術道德，但這裏只做學習參考或交流。找到了壹片帖子/questions/9218641/renaming-the-package-name-inside-an-apk，這篇帖子的回答給了比較詳細的步驟(如上)，他的情況比這個還稍微復雜點，簡化後就是我要的結果，我就是按照這個基本步驟來的，回答的英文比較好懂(很有可能是國人)。
下面就按照上面的步驟壹步步操作：我是已QQ瀏覽器4.0版的apk來操作的。
1、我的apktool安裝到了E盤下的apktool目錄下，所以的操作也在這個目錄下進行?E:\apkTool
?將apk復制到E:\apkTool目錄下，重命名為qq4.0.apk（這個沒有要求，隨意就好）
?將apk解包 ?命令行下cd到E:\apkTool這個目錄 ?apktool d qq4.o.apk qq4 ?將apk解包到qq4(這個也可以隨意)這個目錄
?E:\apkTool\qq4這個目錄下內容如下：
2、修改AndroidManifest.xml中的包名，
?將package後面的包名com.tencent.qbx改為妳想要的新包名，我改為了com.tianxiao.tencentweb
?將涉及原包名的com.tencent.qbx的相關activity的聲明中的包名均改為新包名com.tianxiao.tencentweb
?至於intent-filter裏面的action名中包含原包名的，則可以不改，如果改的話，代碼中也要相應的改變
?另外，如果有provider，provider的authorities也得改，這個在同壹手機上必須唯壹，否則安裝會失敗
3、在E:\apkTool\qq4\smali目錄下，有很多子目錄，子目錄下的文件多以smali結尾，這中文件的語法有點類似於匯編語言，具體原理就不深究了。
?將smali目錄下的所有文件中的原包名的聲明形式com/tencent/qbx改為新包名com/tianxiao/tencentweb
?具體如下，用UEdit在文件中替換即可，將目標目錄指向E:\apkTool\qq4\smali，這個將近1000條左右
?如果之前改為action裏面的包名，也要將字符串形式的包名com.tencent.qbx改為com.tianxiao.tencentweb
?如果有provider也要講原來的authorities值改為在AndroidManifest.xml中新改的authorities值。
4、將E:\apkTool\qq4重新打包為apk
?apktool b qq4 newqq.apk
5、將新的newqq.apk 重新簽名
?簽名的方法很多，壹主要是手動生成簽名，用命令行簽名
?我采用的現成的，下載了壹個Auto-sign的文件夾，進行了簽名，這個比較簡單，網上帖子很多，就不贅述。
?新簽名後的apk名為 ?newqq4signed.apk
6、驗證簽名 是否正確
?jarsigner -verify ?-verbose -certs newqq4signed.apk
?壹般來說，沒問題，略過
7、優化apk
zipalign -v 4 newqq4signed.apk latestqq.apk 優化過的apk名為latestqq.apk
8、安裝新的apk，驗證是否成功
?這個最好把Eclipse打開，手機連上，查看logcat的安裝信息。
?我嘗試了3次才成功，主要是忘了?provider的authorities的處理，
出錯信息如下:?Can't install because provider name qbx_bookmarks (in package com.tianxiao.tencentweb) is already used by com.tencent.qbx
原因很清楚，所以debug還是相當給力的，原來不喜歡debug，看debug過程可以更好的了解執行過程。