001過山車謀殺案(杜松子酒，伏特加出現，工藤新壹少喝藥)
002董事長的女兒被綁架(阿笠博士知道他的身份，工藤新壹化名江戶川·柯南)。
004大都會暗碼地圖藏寶事件(少年偵探隊成立)
005新幹線爆破(柯南懷疑的兩個黑爆嫌疑人不是黑暗組織)
013奇怪的殺人案(宮野明美出道)
043江戶川柯南綁架(工藤和他的妻子知道新的越來越小)
049外交官謀殺案(下)(服部平次處女作，工藤新壹第壹部復原)
054電子遊戲公司謀殺案(龍舌蘭酒出現並被殺)
058福爾摩斯迷謀殺案(第二集)(平治知道柯南的身份，兩人成為好朋友)
128 10億被黑暗集團搶劫(宮野明美死亡，黑色集團浮出水面)
129來自黑暗組織的女子大學教授謀殺案(海巴拉艾現身稱毒品名為APTX4869)。
162工藤新壹最初事件(小蘭回憶工藤新壹最初事件)
170黑暗中的死角(上集)(重要人物新醫生出現)
176告別黑暗組織(灰色原創)(派斯克現身，任務:暗殺)
177告別黑暗組織(柯南)(宮野誌保第壹次還原，皮耶斯克知道他的身份)
178與黑暗組織告別(解)(皮耶斯克被杜松子酒沈默，貝爾摩出現)
188-山洞裏的偵探組的復活
189危急生命的復活——壹個受傷的偵探
190危急生命復活——第三種選擇(工藤新壹第二次復蘇)
191危急生命復活-黑衣騎士
192-新壹復活回來了
193危急生命復活-約定地點
226格鬥遊戲的陷阱(上)(朱迪出現)
230神秘乘客(上)(赤井秀壹出現)
242元簡直是災難(提到琴酒是左撇子)
254這個大廳裏的犯罪愛情故事4(下)(新醫生可能發現柯南在分析案情，用變聲器)
《來自芝加哥的258個男人》(上)(詹姆斯·布萊克出場)
259個來自芝加哥的男人(第二部分)(稱柯南為夏洛克·福爾摩斯，酷家夥)
269犯罪遺跡(上)(毛利小五郎檔案被盜，目標是柯南)
270犯罪的遺跡(第二集)
272匆忙掩蓋的疏忽(第二部分)(柯南被懷疑，情況危急)
274鬼屋的真相(上)(新醫生的住處，柯南也認為新醫生聽到了柯南對案情的分析)
277英語老師VS西方名偵探(上集)(柯南請博士調查克裏斯·賓亞德)
《中華街284號雨中似曾相識》(上)(小蘭回憶紐約的故事包括克裏斯和壹休)
中華街285號雨中的似曾相識(下)
286工藤新壹紐約事件(事件)(知道克裏斯是已故美國明星莎倫·賓亞德的女兒)。)287工藤新壹紐約事件(推理)
288工藤新壹紐約事件(解)(貝爾摩以殺人犯的身份出現，布蘭奇追蹤到他。蘭知道秀吉就是。末了，莎倫對尤西子說，我也有我的天使。
307無聲的證據(上)(再次抓住黑暗組織的尾巴)
308無聲的證據(下)(下集介紹)
309與黑暗組織接觸(談判)(柯南得知該組織正在聘請計算機工程師編寫壹個神秘的系統軟件)310與黑暗組織接觸(後續)(詳細研究板倉的日記以獲取信息)
311接觸黑暗組織(致命章節)(跟蹤組織，差點被Gin發現。海原愛對赤井秀壹有感情)335東京電影制片廠的秘密(第壹部)(阿修羅被跟蹤，雨要來了)
339四輛保時捷(第二部)(朱迪和阿凱發現阿沙拉與黑人組織有聯系，貝爾摩知道阿沙拉的身份)340藏在廁所裏的秘密(第壹部)
341藏在廁所裏的秘密(下)(阿沙拉在廁所裏發現了他母親的錄音留言)
343便利店的陷阱(第壹部分)
便利店344的陷阱(第二部)(小蘭在朱迪公寓的墻後發現了照片，引起了對朱迪身份的懷疑，為下壹集從朱迪的後備箱出現並救出阿沙拉做了鋪墊)
與黑組織面對面！滿月之夜的雙星神秘事件(朱迪、阿凱和詹姆士是美國聯邦調查局；；貝爾摩答應柯南:放棄雪莉；解釋了工藤新壹286-288 NY事件的所有線索)
尋找P股上的印記(第壹部)(朱迪希望加入證人保護計劃，為上壹集善後)
尋找P股上的印記(下)(抱歉拒絕參與證人保護計劃)
361迪丹高中鬧鬼學校(第壹部)(真正的新博士回歸)
375星與香煙的代碼(第二部)(柯南聽說山村警官給boss發信息時叫他奶奶的關鍵音和貝爾摩的相似，推測Boss在鳥取縣)。
斯特拉迪瓦裏小提琴的不協和音(coda)(老板手機號是七個孩子的旋律)
394怪屋奇遇(封印)(boss的手機號被柯南破解了，看來他對boss有所了解)
395奇怪的房子冒險(操縱)
396奇怪的房子歷險記(解)
425被組織魔爪觸碰的瞬間(水無憐奈、基安蒂酒、科恩出現，硝煙再起)
429回不去以前的兩個人(第壹部)(影遊出現在這個大廳裏)
462黑暗組織的影子，壹個年輕的見證者(本堂的應友表演的很精彩，引起了柯南的註意)
黑暗組織的陰影被奇妙地照亮了，黑暗組織的神秘陰影得到了很高的回報。
黑暗組織的陰影，珍珠的流星(最後提到了貝爾摩的咒語)
最精彩的系列，壹定要看。
491紅黑碰撞的開始
492紅與黑的碰撞血緣關系
493紅與黑的碰撞絕對稱得上。
494紅色和黑色的碰撞
495紅色和黑色之間的碰撞昏睡
496紅黑碰撞入侵
497紅與黑的碰撞覺醒
498紅色和黑色的碰撞令人不安。
499紅黑碰撞迷彩
500紅與黑碰撞的遺言
501紅黑之間疑似碰撞
502紅色和黑色的碰撞是白色的
503紅色和黑色的沖突
504紅黑相撞死亡。
507卡拉ok包房的壹角(第壹部分)
508卡拉ok包房壹角(第二部)(應友得知柯南是工藤新壹，說美國聯邦調查局出事了，柯南笑著說，嗯，沒事。讓赤井秀壹的死更假...)
509紅白黃偵探組(水無憐奈給朱迪發消息，組織派出代號為波旁的成員調查雪莉。當沖矢昴出現時，海原愛註意到了壹些奇怪的事情)
510柯南VS W碼之謎(案子破了，柯南把自己的家借給沖矢昴說:作為回報，妳要照看好自己的家；常成功躲過蘭的攻擊，假裝被踢。
511推理對抗！新壹屆VS沖矢昴(漂亮推理直播，沖矢昴推理能力堪比柯南；喝波本威士忌)
521殺人犯工藤新壹
522新壹的真實身份和蘭的眼淚(第三部復蘇)
525仇恨藍色火花(下)(破案成功，柯南與常默契配合)
542壹塊讓魚消失的墻角石(第壹部)(沖矢昴代替醫生接少年偵探隊，遇到壹個案子)
543壹塊讓魚消失的角石(下)(沖矢昴的話幾乎等於阿修羅的話，阿修羅又覺得有壓迫感；最後，阿沙拉盯著工藤的房子說:那個人，真的是...)
563偵探組VS土匪組(暴動)(朱迪卷入強盜案)
564偵探組VS土匪組(沈默)(壹個疑似壹休的人出現，右手射殺柯南；少年偵探隊知道朱迪的身份)
578召喚危機的紅色預兆(美國聯邦調查局在找秀吉；沖矢昴也出現在米花樓)
579黑和13提示(疑似秀吉的人和沖矢昴同時出現，局面再次混亂，赤井之死疑似)580急黑時限(基爾疑似身份，琴酒準備讓基安蒂酒攻擊疑似秀吉的人)。
581紅色搖擺目標(沖矢昴稱該組織為‘笨狼’，似乎很了解柯南，好像在發言中向柯南傳遞了壹些信息；狙擊失敗，boss下令撤退)
值得壹提的是，005與漫畫版中的電視版不同。漫畫版的兩個人是杜松子酒和伏特加。柯南無意中聽到了他們的對話，得知了他們的代號。不過電視版換成了兩個長相差不多的人。後來在動畫版052中(標題介紹了杜松子酒和伏特加，壹開始不是054)，柯南不知怎麽就知道了杜松子酒和伏特加的代號。這成為柯南電視故事的漏洞，卻無法彌補。而且在漫畫《奇異兇殺》中，宮野明美與杜松子酒和伏特加聯系在壹起，然後被殺，動畫版改成了被警察逮捕。這壹集和動畫版128集很像。可以說第128集是壹個補丁，但是這個補丁有壹些疏漏:在第13集，小蘭和毛利大叔明明知道宮野明美(也就是廣田亞米)，但是在第128集，就變成了只有柯南知道廣田亞米，而小五郎。