Autokey密碼
置換密碼
二字母組代替密碼 (by Charles Wheatstone)
多字母替換密碼
希爾密碼
維吉尼亞密碼
替換式密碼
凱撒密碼
摩爾斯電碼
ROT13
仿射密碼
Atbash密碼
換位密碼
Scytale
Grille密碼
VIC密碼 （壹種復雜的手工密碼，在五十年代早期被至少壹名蘇聯間諜使用過，在當時是十分安全的）
流密碼
LFSR流密碼
EIGamal密碼
RSA密碼
對傳統密碼學的攻擊
頻率分析
重合指數
經典密碼學
在近代以前，密碼學只考慮到信息的機密性（confidentiality）：如何將可理解的信息轉換成難以理解的信息，並且使得有秘密信息的人能夠逆向回復，但缺乏秘密信息的攔截者或竊聽者則無法解讀。近數十年來，這個領域已經擴展到涵蓋身分認證（或稱鑒權）、信息完整性檢查、數字簽名、互動證明、安全多方計算等各類技術。
古中國周朝兵書《六韜．龍韜》也記載了密碼學的運用，其中的《陰符》和《陰書》便記載了周武王問姜子牙關於征戰時與主將通訊的方式： 太公曰：“主與將，有陰符，凡八等。有大勝克敵之符，長壹尺。破軍擒將之符，長九寸。降城得邑之符，長八寸。卻敵報遠之符，長七寸。警眾堅守之符，長六寸。請糧益兵之符，長五寸。敗軍亡將之符，長四寸。失利亡士之符，長三寸。諸奉使行符，稽留，若符事聞，泄告者，皆誅之。八符者，主將秘聞，所以陰通言語，不泄中外相知之術。敵雖聖智，莫之能識。”
武王問太公曰：“… 符不能明；相去遼遠，言語不通。為之奈何？”
太公曰：“諸有陰事大慮，當用書，不用符。主以書遺將，將以書問主。書皆壹合而再離，三發而壹知。再離者，分書為三部。三發而壹知者，言三人，人操壹分，相參而不相知情也。此謂陰書。敵雖聖智，莫之能識。” 陰符是以八等長度的符來表達不同的消息和指令，可算是密碼學中的替代法（en:substitution），把信息轉變成敵人看不懂的符號。至於陰書則運用了移位法，把書壹分為三，分三人傳遞，要把三份書重新拼合才能獲得還原的信息。
除了應用於軍事外，公元四世紀婆羅門學者伐蹉衍那（en:Vatsyayana） 所書的《欲經》4 中曾提及到用代替法加密信息。書中第45項是秘密書信（en:mlecchita-vikalpa） ，用以幫助婦女隱瞞她們與愛郞之間的關系。其中壹種方法是把字母隨意配對互換，如套用在羅馬字母中，可有得出下表： A B C D E F G H I J K L M Z Y X W V U T S R Q P O N 由經典加密法產生的密碼文很容易泄漏關於明文的統計信息，以現代觀點其實很容易被破解。阿拉伯人津帝（en:al-Kindi）便提及到如果要破解加密信息，可在壹篇至少壹頁長的文章中數算出每個字母出現的頻率，在加密信件中也數算出每個符號的頻率，然後互相對換，這是頻率分析的前身，此後幾乎所有此類的密碼都馬上被破解。但經典密碼學仍未消失，經常出現在謎語之中（見en:cryptogram）。這種分析法除了被用在破解密碼法外，也常用於考古學上。在破解古埃及象形文字（en:Hieroglyphs）時便運用了這種解密法。 標準機構
the Federal Information Processing Standards Publication program (run by NIST to produce standards in many areas to guide operations of the US Federal government; many FIPS Pubs are cryptography related,ongoing)
the ANSI standardization process (produces many standards in many areas; some are cryptography related,ongoing)
ISO standardization process (produces many standards in many areas; some are cryptography related,ongoing)
IEEE standardization process (produces many standards in many areas; some are cryptography related,ongoing)
IETF standardization process (produces many standards (called RFCs) in many areas; some are cryptography related,ongoing)
See Cryptography standards
加密組織
NSA internal evaluation/selections (surely extensive,nothing is publicly known of the process or its results for internal use; NSA is charged with assisting NIST in its cryptographic responsibilities)
GCHQ internal evaluation/selections (surely extensive,nothing is publicly known of the process or its results for GCHQ use; a division of GCHQ is charged with developing and recommending cryptographic standards for the UK government)
DSD Australian SIGINT agency - part of ECHELON
Communications Security Establishment (CSE) － Canadian intelligence agency.
努力成果
the DES selection (NBS selection process,ended 1976)
the RIPE division of the RACE project (sponsored by the European Union,ended mid-'80s)
the AES competition (a 'break-off' sponsored by NIST; ended 2001)
the NESSIE Project (evaluation/selection program sponsored by the European Union; ended 2002)
the CRYPTREC program (Japanese government sponsored evaluation/recommendation project; draft recommendations published 2003)
the Internet Engineering Task Force (technical body responsible for Internet standards -- the Request for Comment series: ongoing)
the CrypTool project (eLearning programme in English and German; freeware; exhaustive educational tool about cryptography and cryptanalysis)
加密散列函數 （消息摘要算法，MD算法）
加密散列函數
消息認證碼
Keyed-hash message authentication code
EMAC (NESSIE selection MAC)
HMAC (NESSIE selection MAC; ISO/IEC 9797-1,FIPS and IETF RFC)
TTMAC 也稱 Two-Track-MAC (NESSIE selection MAC; K.U.Leuven (Belgium) & debis AG (Germany))
UMAC (NESSIE selection MAC; Intel,UNevada Reno,IBM,Technion,& UCal Davis)
MD5 （系列消息摘要算法之壹，由MIT的Ron Rivest教授提出； 128位摘要）
SHA-1 (NSA開發的160位摘要，FIPS標準之壹；第壹個發行發行版本被發現有缺陷而被該版本代替； NIST/NSA 已經發布了幾個具有更長'摘要'長度的變種； CRYPTREC推薦 (limited))
SHA-256 (NESSIE 系列消息摘要算法，FIPS標準之壹180-2，摘要長度256位 CRYPTREC recommendation)
SHA-384 (NESSIE 列消息摘要算法，FIPS標準之壹180-2，摘要長度384位； CRYPTREC recommendation)
SHA-512 (NESSIE 列消息摘要算法，FIPS標準之壹180-2，摘要長度512位； CRYPTREC recommendation)
RIPEMD-160 （在歐洲為 RIPE 項目開發，160位摘要；CRYPTREC 推薦 (limited))
Tiger (by Ross Anderson et al)
Snefru
Whirlpool (NESSIE selection hash function,Scopus Tecnologia S.A. (Brazil) & K.U.Leuven (Belgium))
公/私鑰加密算法（也稱 非對稱性密鑰算法)
ACE-KEM (NESSIE selection asymmetric encryption scheme; IBM Zurich Research)
ACE Encrypt
Chor-Rivest
Diffie-Hellman(key agreement; CRYPTREC 推薦）
El Gamal （離散對數）
ECC（橢圓曲線密碼算法） （離散對數變種）
PSEC-KEM (NESSIE selection asymmetric encryption scheme; NTT (Japan); CRYPTREC recommendation only in DEM construction w/SEC1 parameters) )
ECIES (Elliptic Curve Integrated Encryption System; Certicom Corp)
ECIES-KEM
ECDH （橢圓曲線Diffie-Hellman 密鑰協議； CRYPTREC推薦）
EPOC
Merkle-Hellman (knapsack scheme)
McEliece
NTRUEncrypt
RSA （因數分解）
RSA-KEM (NESSIE selection asymmetric encryption scheme; ISO/IEC 18033-2 draft)
RSA-OAEP (CRYPTREC 推薦）
Rabin cryptosystem （因數分解）
Rabin-SAEP
HIME(R)
XTR
公/私鑰簽名算法
DSA（zh:數字簽名;zh-tw:數位簽章算法） （來自NSA,zh：數字簽名；zh-tw：數位簽章標準（DSS）的壹部分； CRYPTREC 推薦）
Elliptic Curve DSA (NESSIE selection digital signature scheme; Certicom Corp); CRYPTREC recommendation as ANSI X9.62,SEC1)
Schnorr signatures
RSA簽名
RSA-PSS (NESSIE selection digital signature scheme; RSA Laboratories); CRYPTREC recommendation)
RSASSA-PKCS1 v1.5 (CRYPTREC recommendation)
Nyberg-Rueppel signatures
MQV protocol
Gennaro-Halevi-Rabin signature scheme
Cramer-Shoup signature scheme
One-time signatures
Lamport signature scheme
Bos-Chaum signature scheme
Undeniable signatures
Chaum-van Antwerpen signature scheme
Fail-stop signatures
Ong-Schnorr-Shamir signature scheme
Birational permutation scheme
ESIGN
ESIGN-D
ESIGN-R
Direct anonymous attestation
NTRUSign用於移動設備的公鑰加密算法，密鑰比較短小但也能達到高密鑰ECC的加密效果
SFLASH (NESSIE selection digital signature scheme (esp for smartcard applications and similar); Schlumberger (France))
Quartz
秘密鑰算法 （也稱 對稱性密鑰算法)
流密碼
A5/1,A5/2 (GSM移動電話標準中指定的密碼標準）
BMGL
Chameleon
FISH (by Siemens AG)
二戰'Fish'密碼
Geheimfernschreiber （二戰時期Siemens AG的機械式壹次壹密密碼，被布萊奇利（Bletchley）莊園稱為STURGEON)
Schlusselzusatz （二戰時期 Lorenz的機械式壹次壹密密碼，被布萊奇利（Bletchley）莊園稱為[[tunny)
HELIX
ISAAC （作為偽隨機數發生器使用）
Leviathan (cipher)
LILI-128
MUG1 (CRYPTREC 推薦使用）
MULTI-S01 (CRYPTREC 推薦使用）
壹次壹密 (Vernam and Mauborgne,patented mid-'20s; an extreme stream cypher)
Panama
Pike (improvement on FISH by Ross Anderson)
RC4 (ARCFOUR) (one of a series by Prof Ron Rivest of MIT; CRYPTREC 推薦使用 (limited to 128-bit key))
CipherSaber (RC4 variant with 10 byte random IV，易於實現)
SEAL
SNOW
SOBER
SOBER-t16
SOBER-t32
WAKE
分組密碼
分組密碼操作模式
乘積密碼
Feistel cipher （由Horst Feistel提出的分組密碼設計模式）
Advanced Encryption Standard （分組長度為128位； NIST selection for the AES,FIPS 197,2001 -- by Joan Daemen and Vincent Rijmen; NESSIE selection; CRYPTREC 推薦使用）
Anubis (128-bit block)
BEAR （由流密碼和Hash函數構造的分組密碼，by Ross Anderson)
Blowfish （分組長度為128位； by Bruce Schneier,et al)
Camellia （分組長度為128位； NESSIE selection (NTT & Mitsubishi Electric); CRYPTREC 推薦使用）
CAST-128 (CAST5) (64 bit block; one of a series of algorithms by Carlisle Adams and Stafford Tavares,who are insistent (indeed,adamant) that the name is not due to their initials)
CAST-256 (CAST6) (128位分組長度； CAST-128的後繼者，AES的競爭者之壹）
CIPHERUNICORN-A （分組長度為128位； CRYPTREC 推薦使用）
CIPHERUNICORN-E (64 bit block; CRYPTREC 推薦使用 (limited))
CMEA － 在美國移動電話中使用的密碼，被發現有弱點.
CS-Cipher (64位分組長度)
DESzh：數字；zh-tw：數位加密標準（64位分組長度； FIPS 46-3,1976)
DEAL － 由DES演變來的壹種AES候選算法
DES-X 壹種DES變種，增加了密鑰長度.
FEAL
GDES －壹個DES派生，被設計用來提高加密速度.
Grand Cru (128位分組長度）
Hierocrypt-3 (128位分組長度； CRYPTREC 推薦使用））
Hierocrypt-L1 (64位分組長度； CRYPTREC 推薦使用 (limited))
International Data Encryption Algorithm (IDEA) (64位分組長度--蘇黎世ETH的James Massey & X Lai)
Iraqi Block Cipher (IBC)
KASUMI (64位分組長度； 基於MISTY1，被用於下壹代W-CDMAcellular phone 保密）
KHAZAD (64-bit block designed by Barretto and Rijmen)
Khufu and Khafre (64位分組密碼）
LOKI89/91 (64位分組密碼）
LOKI97 (128位分組長度的密碼，AES候選者）
Lucifer (by Tuchman et al of IBM,early 1970s; modified by NSA/NBS and released as DES)
MAGENTA (AES 候選者）
Mars (AES finalist,by Don Coppersmith et al)
MISTY1 (NESSIE selection 64-bit block; Mitsubishi Electric (Japan); CRYPTREC 推薦使用 (limited))
MISTY2 （分組長度為128位：Mitsubishi Electric (Japan))
Nimbus (64位分組)
Noekeon （分組長度為128位）
NUSH （可變分組長度（64 - 256位））
Q （分組長度為128位）
RC2 64位分組，密鑰長度可變.
RC6 （可變分組長度； AES finalist,by Ron Rivest et al)
RC5 (by Ron Rivest)
SAFER （可變分組長度）
SC2000 （分組長度為128位； CRYPTREC 推薦使用）
Serpent （分組長度為128位； AES finalist by Ross Anderson,Eli Biham,Lars Knudsen)
SHACAL-1 (256-bit block)
SHACAL-2 (256-bit block cypher; NESSIE selection Gemplus (France))
Shark (grandfather of Rijndael/AES,by Daemen and Rijmen)
Square (father of Rijndael/AES,by Daemen and Rijmen)
3-Way (96 bit block by Joan Daemen)
TEA（小型加密算法）（by David Wheeler & Roger Needham)
Triple DES (by Walter Tuchman,leader of the Lucifer design team -- not all triple uses of DES increase security,Tuchman's does; CRYPTREC 推薦使用 (limited),only when used as in FIPS Pub 46-3)
Twofish （分組長度為128位； AES finalist by Bruce Schneier,et al)
XTEA (by David Wheeler & Roger Needham)
多表代替密碼機密碼
Enigma （二戰德國轉輪密碼機--有很多變種，多數變種有很大的用戶網絡）
紫密（Purple) （二戰日本外交最高等級密碼機；日本海軍設計）
SIGABA （二戰美國密碼機，由William Friedman,Frank Rowlett，等人設計）
TypeX （二戰英國密碼機）
Hybrid code/cypher combinations
JN-25 （二戰日本海軍的高級密碼； 有很多變種）
Naval Cypher 3 (30年代和二戰時期英國皇家海軍的高級密碼）
可視密碼
有密級的 密碼 （美國）
EKMS NSA的電子密鑰管理系統
FNBDT NSA的加密窄帶話音標準
Fortezza encryption based on portable crypto token in PC Card format
KW-26 ROMULUS 電傳加密機（1960s - 1980s)
KY-57 VINSON 戰術電臺語音加密
SINCGARS 密碼控制跳頻的戰術電臺
STE 加密電話
STU-III 較老的加密電話
TEMPEST prevents compromising emanations
Type 1 products
雖然頻率分析是很有效的技巧，實際上加密法通常還是有用的。不使用頻率分析來破解壹個信息需要知道是使用何種加密法，因此才會促成了諜報、賄賂、竊盜或背叛等行為。直到十九世紀學者們才體認到加密法的算法並非理智或實在的防護。實際上，適當的密碼學機制（包含加解密法）應該保持安全，即使敵人知道了使用何種算法。對好的加密法來說，鑰匙的秘密性理應足以保障資料的機密性。這個原則首先由奧古斯特·柯克霍夫（Auguste Kerckhoffs）提出並被稱為柯克霍夫原則（Kerckhoffs' principle）。信息論始祖克勞德·艾爾伍德·香農（Claude Shannon）重述：“敵人知道系統。”
大量的公開學術研究出現，是現代的事，這起源於壹九七零年代中期，美國國家標準局（National Bureau of Standards,NBS；現稱國家標準技術研究所，National|Institute of Standards and Technology,NIST）制定數字加密標準（DES），Diffie和Hellman提出的開創性論文，以及公開釋出RSA。從那個時期開始，密碼學成為通訊、電腦網絡、電腦安全等上的重要工具。許多現代的密碼技術的基礎依賴於特定基算問題的困難度，例如因子分解問題或是離散對數問題。許多密碼技術可被證明為只要特定的計算問題無法被有效的解出，那就安全。除了壹個著名的例外：壹次墊（one-time pad，OTP），這類證明是偶然的而非決定性的，但是是目前可用的最好的方式。
密碼學算法與系統設計者不但要留意密碼學歷史，而且必須考慮到未來發展。例如，持續增加計算機處理速度會增進暴力攻擊法（brute-force attacks）的速度。量子計算的潛在效應已經是部份密碼學家的焦點。
二十世紀早期的密碼學本質上主要考慮語言學上的模式。從此之後重心轉移，數論。密碼學同時也是工程學的分支，但卻是與別不同，因為它必須面對有智能且惡意的對手，大部分其他的工程僅需處理無惡意的自然力量。檢視密碼學問題與量子物理間的關連也是熱門的研究。
現代密碼學大致可被區分為數個領域。對稱鑰匙密碼學指的是傳送方與接收方都擁有相同的鑰匙。直到1976年這都還是唯壹的公開加密法。
現代的研究主要在分組密碼（block cipher）與流密碼（stream cipher）及其應用。分組密碼在某種意義上是阿伯提的多字符加密法的現代化。分組密碼取用明文的壹個區塊和鑰匙，輸出相同大小的密文區塊。由於信息通常比單壹區塊還長，因此有了各種方式將連續的區塊編織在壹起。DES和AES是美國聯邦政府核定的分組密碼標準（AES將取代DES）。盡管將從標準上廢除，DES依然很流行（3DES變形仍然相當安全），被使用在非常多的應用上，從自動交易機、電子郵件到遠端存取。也有許多其他的區塊加密被發明、釋出，品質與應用上各有不同，其中不乏被破解者。
流密碼，相對於區塊加密，制造壹段任意長的鑰匙原料，與明文依位元或字符結合，有點類似壹次壹密密碼本（one-time pad）。輸出的串流根據加密時的內部狀態而定。在壹些流密碼上由鑰匙控制狀態的變化。RC4是相當有名的流密碼。
密碼雜湊函數（有時稱作消息摘要函數，雜湊函數又稱散列函數或哈希函數）不壹定使用到鑰匙，但和許多重要的密碼算法相關。它將輸入資料（通常是壹整份文件）輸出成較短的固定長度雜湊值，這個過程是單向的，逆向操作難以完成，而且碰撞（兩個不同的輸入產生相同的雜湊值）發生的機率非常小。
信息認證碼或押碼（Message authentication codes,MACs）很類似密碼雜湊函數，除了接收方額外使用秘密鑰匙來認證雜湊值。