以前是需要準備出生、國籍等公證，正如2樓所述，其他公證都是多此壹舉、沒有必要的，或許入管局也發現了這壹點，因此做了更改。
另外婚姻公證的翻譯件不用委托翻譯公司或公證處的翻譯處翻譯，可以自己翻譯或委托身邊會日語的朋友手寫翻譯即可，落款處別忘了讓翻譯人簽名蓋章，我經常幫別人翻譯，這壹點可以肯定沒有問題。
另外與配偶認識的經維要盡量寫的詳細，雙方在不同季節的照片也是很好的證明；通信、通電話的記錄最好也付上。目前赴日的“外國人配偶”簽證審批的比較嚴格，所以我認為還是謹慎點為好。
下面是日本入國管理局的相關網站，需準備的材料仔細對照壹下吧。
http://www.moj.go.jp/ONLINE/IMMIGRATION/ZAIRYU_NINTEI/zairyu_nintei1_01.html
補充：很抱歉，我的回答有可能誤導了妳準備材料的進程。
今天向日本的律師事物所了解了壹下情況，得到的答復是需要準備”結婚公證和國籍公證”；又向壹位與日本人結婚的朋友了解了壹下，答復是中國公證處的要求是“結婚、國籍、出生的公證件都需要”，雖然入管沒有作出明確的要求，但大家基本上都是按照公證處的要求來準備的，為了確保萬壹，我建議妳也按照他們的要求來做吧。至於翻譯件的確可以自己翻譯。