手工分離是指將采摘下來的棉花進行晾曬，然後將棉花籽與棉花纖維分開，主要是利用棉花籽與棉花纖維的物理特性不同，通過手工篩選、敲打等方式將棉花籽與棉花纖維分離開來。這種方法適用於小規模生產，成本較低，但生產效率較低。
機械分離是指利用機械設備進行分離，主要包括皮輥軋花機、鋸齒軋花機和振動篩等設備。這些設備通過將棉花纖維與棉花籽分離，從而實現棉花籽與棉花纖維的分離。機械分離的優點是生產效率高，分離精度高，適用於大規模生產。
化學分離是指通過化學方法將棉花籽與棉花纖維分離開來。這種方法通常使用酒精、醋等化學物質將棉花籽浸泡，從而將棉花籽與棉花纖維分離開來。化學分離的優點是成本低，適用於小規模生產。
需要註意的是，無論采用哪種方法，分離棉花籽都需要在安全的條件下進行，避免對環境和人體健康造成危害。