1、位置和地理特征區別：麥哲倫海峽位於南美洲南端，與火地島等島嶼之間，是溝通大西洋和太平洋的重要通道，全長約563公裏，最窄處寬度僅為3.3至32公裏，而德雷克海峽則位於南美洲和南極洲之間，是世界上最寬的海峽，寬度可達970公裏，最窄處也有890公裏，連接著太平洋和大西洋，地理位置十分重要。
2、海域條件區別：麥哲倫海峽因其狹窄的寬度和曲折的航道而聞名，也是世界上風浪最猛烈的水域之壹，海峽內寒冷多霧，並經常出現大風暴，而德雷克海峽同樣寬闊，但其受到了西風帶和南極冰蓋的影響，氣候條件非常惡劣，浪高水急，還有浮冰的影響。
3、麥哲倫海峽是南大西洋與南太平洋之間最重要的天然航道，16世紀葡萄牙航海家麥哲倫自信在此終有壹條通往南海（太平洋的航道）。