(壹)留存適度的原則
留存適度是指在礦區內要保留有代表性的控制鉆孔剖面，如果地層、構造等方面具有重要意義的鉆孔，全孔保留，不能縮減。
在下列情況下還需適當增加留存：在我國屬於特有型或新型礦床；研究認定是特有成因且具代表性的礦床；分析認為礦石組分復雜、選冶性能差、綜合利用問題尚未能解決的礦床；工業開發遠景不明的礦區；未能進行綜合評價的礦區；在國內外知名度較高或具有特殊意義的稀有礦產等。區域內雖然有進壹步工作價值，但卻保存著較多鉆孔實物資料時，只留有代表性的鉆孔巖心、巖屑。
(二)處理慎重原則
慎重處理是指審查批準和填埋地點的選擇兩個環節。
提出縮減建議清單的應該是技術專業管理部門和實物資料管理部門。提出建議的人，他們最知道哪個礦區的相關礦產的勘探與開發工作量達到相對飽和與否，對哪些區塊的地質認識相對清楚，哪個區域擁有的鉆井性質相同或相似，館藏實物資料的具體保管情況等。
審核縮減清單應該由總工程師主持。
批準縮減清單的應該是上級主管部門。
選擇填埋地點要考慮不易受到破壞，填埋的巖心能重新發掘利用。縮減的只能是重復的、多余的、無保存價值的巖心等實物資料。如A井與B井點位挨得很近，兩口井的巖心情況基本壹致，可以只保留其中的A井或B井。某區塊有壹口井，取心100米的巖心都是火山巖，巖性與礦物基本壹致，保存100米中代表性的三分之壹即可。
(三)經濟合理原則
經濟合理是指既要考慮巖心管理成本，又要考慮巖心的利用價值。勘探井的巖心大多是不設管理期限的，壹般為永久保存；開發井巖心需要考慮保管這些巖心巖屑設備設施成本和維護費用，但也要考慮縮減巖心、巖屑也會形成費用。
保留圖像是指對決定縮減的巖心進行數據圖像保留，沒有掃描設備的，要進行攝影和攝像保存。
(四)定點埋存原則
定點埋存是指對決定縮減的巖心不能當垃圾處理，要選擇合適地點有序填埋。做到巖心、巖屑既不汙染環境，又不易受到破壞，同時又能便於今後需要時重新發掘利用。這個點的選擇，是在查看當地建設規劃基礎上，避免被當地建設破壞，避免遭受自然災害侵害(山體滑坡、洪水淹沒等)，填埋坑的四周用水泥體隔絕，防止巖心對環境的汙染。