玉清宮始建於宋朝末代，距今七百多年。清康熙九年重修；道光十二年被強臺風摧毀後，十九年由道士廖道壽主持重建；民國二十二年又被臺風摧倒，道士走散。之後，由於失修及經“文革”期間破“四舊”的清理，玉清宮僅存壹片廢宮。直至壹九八壹年，開始接受社會熱心人士和回鄉探親的港澳臺同胞以及僑胞的支持和資助下著手修建。經多年來的積極籌措修復工作，現有大小殿房二十五間，面積壹千三百平方米。恢復和擴建後的玉清宮，按道教規範格式建築，結構嚴謹古樸素雅，造型美觀，殿內塑有道教供奉的多尊神像，已投入資金壹百多萬元，初具壹定規模。
玉清宮於壹九九二年九月二十四日經縣人民政府作為道教活動場所，正式批準開放，主持是道教正宗全真龍門派第二十五代弟子陳信泰。現在，玉清宮常住道人按照政府的宗教政策並結合道教的規儀開展正常的宗教活動，並繼續努力做好宮中配套工程修建工作。
相傳，宋端宗二年(公元壹二七六年)，宋帝_及朝臣陸秀夫、張世傑等抗金南走惠來覽表，渡瀛江到渡頭山時，曾在玉清宮內食宿，駐軍待渡山下，豎日登甲子門。期間，宋帝宮侍玄女跟隨宋帝因病逝世，葬於渡頭山西北坡，宋時建有玄女亭以誌紀念，古亭猶存。有詩曰：“玉清埋忠骨，千古留英名”。玉清官左前側雕有道教老君石像，門的兩旁左有天然石龜、右有赤蛇石屹立，面朝殿前玄武，古風猶存!玉清宮座北朝南，右纏鰲江，東臨瀛江，面向甲子港。登上高處遠眺，壹派天然景象，盡收眼底，令人贊嘆!玉清宮是道教徒學道修持的好場所，也是旅遊觀光的好地方。
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