（壹）根
瓠瓜根系較淺，再生能力弱，側根發達，橫向伸展能力較強，壹般可達3m左右，部分品種在肥力水平高，通透性好的沙壤土中可伸至4m以外。瓠瓜的下胚軸（子葉以下部分根莖）於土壤中能分生不定根，特別是在老根受損時能產生多條側根，並起到較好的替代作用。不同品種根的垂直伸展能力也有不同，壹般長瓠子根系較淺，主要根群垂直分布在20cm左右，再生能力弱，傷根後不易恢復生長。而圓葫蘆根系較深，達25cm以上，抗旱能力較強。但它們的耐澇性都差。
（二）莖
瓠瓜莖蔓生、分枝能力強，特別是當主莖受損後會很快產生多條側蔓，當側蔓頂部受損後，在肥水供應充足的情況下又可在側蔓上分生孫蔓……。莖蔓橫斷面呈五棱形，表皮上分生細刺毛。瓠瓜子葉以上的1～5葉節節間特別短，是主莖由直立性轉向匍匐之前的節位，其中尤以第三至第五節間出現的側蔓生長優勢最強。
瓠瓜莖蔓的節間長度因品種和栽培條件不同而異，但每個節上都有壹個花原基，根原基，側枝原基和苞葉原基；如進行爬地栽培，其接觸地面或接近地面的莖節能產生1～3條不定根，有很強的吸肥、吸水能力。
（三）葉
瓠瓜葉面大而薄，單葉互生，心臟形或腎形，不分裂或稍淺裂，葉緣有小齒，葉柄長，頂端具兩個腺體，葉面有茸毛。基部幾片葉較小，多數品種葉全緣，俗稱板葉。以後隨蔓的伸展葉面積增大，出現本品種的固有形態，其葉片的大小、葉柄的長度因品種不同而異。
瓠瓜為喜光作物，在弱光照條件下節間和葉柄將迅速伸長。瓠瓜葉片的蒸騰量大，對肥水要求高，如肥水不能滿足，會導致畸形瓜增多。
（四）花
瓠瓜花白色、單生，花梗長；雄花花托漏鬥狀，長約2cm，花萼裂片披針形，長3mm左右，花冠裂片皺波形，披柔毛或黏毛，長3～4cm，寬2～3cm，雄蕊3枚，藥室不規則折曲；雌花花萼和花冠似雄花。雌雄異花同株，蟲媒花，異花授粉。雄花、雌花均在傍晚開始逐漸開放，第二天8、9時花冠雕萎，雌蕊、花粉也失去生活力，“夜開花”之稱由此而來。其絕大多數品種側蔓著生雌花早於主蔓，側蔓除著生雌花外也可著生雄花。不同品種雌花出現的時間、節位、數目、雌雄花比例差異顯著。壹般雄花的發生早於雌花，其花芽的分化和發育隨著瓜蔓的伸展由低節位向高節位順序推進，有時雌花也可能早於雄花2～3d出現，但第壹朵雌花由於植株營養面積過小而大多為無效花，沒有保留的價值。當瓠瓜開花進入盛花期後，在不整枝情況下會出現2～3朵雌花同時開放的現象。
五）果實
瓠瓜雌花在受精後第二天子房（幼果）開始伸長增粗，但以伸長為主，果柄也相應伸長。雌花在受精後並不是都能發育或發育成理想的商品瓜，這與雌花的質量，受精時植株葉片數、葉面積大小、肥力供應情況、根系的吸收能力以及當時的氣候條件密切相關。同時還與開始發育的幼瓜數密切相關，壹般能同時正常膨大的幼果數為2個，其余的幼瓜都會在受精後1～2d內停止發育。
瓠瓜幼瓜發育較快，多數品種開花後10～15d即可食用。成熟瓜的瓜形大體可根據雌花子房形態來確定，因此在生產上可充分利用其雌花多的特性，及早去除不符合要求或子房畸形的雌花。
瓠瓜瓜形因品種不同而異，有長圓柱、短圓柱，筒狀、棒槌狀，直或稍彎曲（瓠子），有圓形、長頸形（葫蘆），還有中間縊細、下部和上部膨大（細腰葫蘆）或中間縊細、下部大於上部的葫蘆形（觀賞葫蘆）等。瓠瓜嫩瓜瓜面具有白色茸毛，茸毛的疏密與品種有關。果皮有白色、淺綠色、綠色等，且與栽培時的受光量有關，壹般背光面顏色較淺，而爬地栽培的著地面多為黃白色。瓠瓜果肉均為白色，單瓜重0.2～4kg，老熟瓜不堪食用。
（六）種子
瓠瓜坐果後40d左右進入老熟期，茸毛漸退，果皮轉白色或黃褐色，果實大小基本定型，果殼日趨堅硬；50d後多數留種瓜種子達到生理成熟，種瓜采摘後需經1～2周的堆放後熟，種子才能完全成熟。種子成熟的時間與品種及其果實發育期間氣溫有密切關系。
瓠瓜種子扁平，但形態差異較大，有卵圓形、紡錘形、尖三角形等。長瓠子類種子外殼有毛，葫蘆類種子無毛或稀少且短，多數品種發芽孔上方有兩對對稱的突出點。種子上毛的多少、有無、種子色澤與種瓜後熟的堆放時間也有關；未充分堆放後熟的長瓠子種子也可能無毛，色淺；堆放時間過長的葫蘆類種子也會出現較多的毛。正常種子的種仁（子葉）應為白色。瓠瓜的種子大小因品種等的不同而有較大差異，壹般千粒重約125g左右（《浙江效益農業百科全書——瓠瓜》，1999）。