雲南“馬鹿洞人”考古隊中方科學家認為最顯著的意義在於，“馬鹿洞人”是晚期智人，但具有早期智人特征。但要說這種人是中國人的祖先，有點誇張。可以理解為，馬鹿洞人是當時人群中的少數民族。
有學者認為，東亞地區特別是中國的現代人起源研究不斷有新發現。盡管起源於亞洲的證據不如非洲的多，但肯定現代人起源是非洲還是其他地區都為時尚早。 對於人類的起源，國際公認得起源說是：非洲起源說，但仍有部分亞洲學者持保留態度。他們認為，在中國發現的晚期智人頭蓋骨多被認為距今4萬年左右，而超過4萬年的晚期智人化石，在中國出土的較少。