1、定義不同
總股本是指上市公司發行股票的資金總數，主要包括了流通股本和非流通股本；流通股本是指上市公司上市的股份在交易所流通的股份數量總數，已經發行的並且可以在二級市場交易的股份。非流通股本是指目前不能上市交易的股份數。
2、包含關系不同
總股本包括流通股本和非流通股本（限售股），非流通股可能是投資個人持有，也有可能是投資機構持有；流通股可能只是總股本的壹部分，並且包含了可以在二級市場交易的股票。A股市場如果出現總股本等於流通股本的現象時，說明股票處於壹個全解禁的狀態；如果有非流通股的出現的話，說明市場上存在未解禁部分（解禁是指股改後使部分非流通股可以在市場上流通）。
3、性質不同
流通股可以在二級市場上交易買賣；而總股本因為其包含了非流通股，所以在非流通股解禁之前總股本是不能在二級市場進行流通交易的。
註意：持有5%以上的非流通股的股東，24個月以後才能解禁，後續才能上市交易；持有5%以下的非流通股的股東，12個月之後解禁，後續才可上市交易。
流通股本和總股本的聯系：
股票的總股本=流通股本+非流通股本；股本=股數*股價
壹個上市公司的總股本過大，但是流通股較少的話，那麽該股票後期的發展較難。因為其表示該股中非流通股的含量較大，如果在拉升過程中非流通股解禁利空的話，不利於主力拉升股價，後期股價上漲的概率較小；如果總股本較小，流通股本所占比例較大時，說明該股中流通股較多，有利於主力建倉，進而能夠快速推動股價的上漲。
總的來說，投資者可以結合公司的運營情況以及對流通股、總股本的分析，做出更加精準的投資。