波士頓官方找到了壹名爆炸襲擊的嫌疑人，稱嫌疑人是壹名年僅20歲的沙特人，在爆炸中也被嚴重燒傷。該嫌疑人在壹座波士頓醫院中被控制和治療。
此名嫌犯是在當地時間2013年4月15日下午2：50分爆炸發生後兩小時以內被逮捕。波士頓警方從監控錄像中發現曾有人將幾個背包帶到爆炸現場。
2013年4月16日上午，美國FBI發言人宣布，他們在波士頓爆炸裝置中發現了嫌疑人的指紋，還可能找到更多毛發之類的證據，以便於確定嫌疑犯的身份。但FBI現 在還不能確定嫌疑犯是美國境內恐怖分子還是境外的。
2013年4月18日，美國波士頓，美國聯邦調查局（FBI）舉行新聞發布會，公布了爆炸案兩名嫌疑人照片，尋求公眾幫助搜捕。
2013年4月19日，法新社援引波士頓環球報消息，美國警方已經抓獲15日波士頓馬拉松賽爆炸案嫌疑犯，嫌疑犯現已身亡 。
波士頓警方對外宣布波士頓警方當地時間19日晚對外宣布，在逃的爆炸案嫌犯焦哈爾·薩納耶夫已被拘捕。
2013年7月10日，波士頓爆炸案嫌疑人焦哈爾·察爾納耶夫首次在波士頓地區聯邦法庭上公開露面，並對使用大規模殺傷性武器致人死亡等30項指控提出無罪抗辯。 2013年4月16日，FBI新聞公報稱，2013年4月15日爆炸的兩枚炸彈，壹枚被放在壹個高壓鍋裏，並藏在背包中。爆炸後的殘片顯示，制造這枚簡易炸彈的兇手在鍋裏放了釘子、鋼珠等材料。
視頻截圖顯示，爆炸發生前，壹個黃色背包被丟在路邊，靠著人行道柵欄。柵欄的另壹邊，則站滿了為運動員歡呼的人群。而隨著煙霧騰起，四周人群立即倒地。
FBI的公報稱，另壹枚炸彈也被安裝在壹個金屬容器內，但目 前尚不能明確是否也是高壓鍋。 美國檢察官2013年5月1日起訴3名嫌疑人，指控他們妨礙波士頓馬拉松賽爆炸案調查，包庇“二號”嫌疑人焦哈爾·察爾納耶夫。三人年齡皆為19歲，是焦哈爾大學同學，在聯邦調查局公布察爾納耶夫為爆炸案嫌疑人後，涉嫌銷毀證物，壹人對調查人員撒謊。
波士頓聯邦檢察官辦公室說，3人分別是迪亞斯·卡迪爾巴耶夫、阿紮馬特·塔紮亞科夫和羅貝爾·菲利波斯，前兩人是哈薩克斯坦公民，持美國學生簽證，菲利波斯是美國公民。
兩名外籍嫌疑人被控破壞、藏匿和掩蓋證據，妨礙司法公正，可能面臨最高5年監禁和25萬美元罰款;美國籍嫌疑人被控調查期間向聯邦調查人員撒謊，可能面臨最高8年監禁和25萬美元罰款。
3人都是焦哈爾在達特茅斯馬薩諸塞大學的同學。校方1日說，塔紮亞科夫仍是註冊在校生，不過已經被停學，另外兩人當前已不是註冊在校生。在提起阻礙司法公正指控前，執法機構13年4月20日以違反簽證規定為由扣留兩名外籍嫌疑人。 波士頓馬拉松爆炸案的調查人員稱，他們取得了“重大突破”，從監視錄像中找到了第二次爆炸現場的壹名嫌疑人。 這名持有包裹的嫌疑人有可能將包裹放置在爆炸現場，包裹內可能有壹顆炸彈。執法人員此前找到高壓鍋炸彈的殘骸，包括炸飛到附近房頂上的壹個蓋子和藏有炸彈的黑色背包的碎片。警方還找到鍋的碎片，以及據信是引爆裝置壹部分的電線、電池和電路板。這些碎片和從死傷者身上取出的碎片已被送往實驗室進行分析。高壓鍋制造商承諾會協助追查該高壓鍋的出售地點。 調查人員認為，炸彈的制造地點也許在爆炸現場附近，因為長距離運輸這個不穩定的裝置有意外引爆的風險。
美國波士頓警方19日晚宣布，涉嫌制造波士頓馬拉松賽爆炸案的在逃嫌疑人焦哈爾·察爾納耶夫落網。波士頓警方當天淩晨出動9000多名警察，荷槍實彈，全城搜捕這名19歲疑犯。
為逃跑不惜開車碾過重傷的哥哥
19日淩晨1點20分左右，波士頓“貝斯以色列迪康尼斯醫療中心”住進了壹位重傷病患。“當時，大家都在討論到底是什麽人被送進醫院了”，謎底很快揭開，這位不省人事、傷痕累累的病人就是波士頓爆炸案和麻省理工學院槍擊案嫌犯之壹塔梅爾蘭·察爾納耶夫。 目擊者稱，18日晚，塔梅爾蘭在沃特敦鎮與警方交火時身受重傷，“當時，另壹名嫌犯焦哈爾看見他的哥哥中槍倒地了，不僅沒有上去攙扶，反而立即跳上車打算逃跑。沒過幾秒鐘，車子啟動了，焦哈爾開車向西疾馳而去，途中還軋過了躺在地上的塔梅爾蘭”。值班醫生戴維·舍恩菲爾德表示，目擊者的描述應該屬實。“塔梅爾蘭身上有多處槍傷。此外，從他的胸腔至背部有壹道巨大的開放性傷口，而在開放性傷口的右下方，還有壹處很深的傷口，這些可能是遭重物碾壓造成的。”
二號嫌疑人（弟弟）
姓名：焦哈爾·察爾納耶夫
年齡：19歲
目 前情況：被活捉
壹號嫌疑人（哥哥）
姓名：塔梅爾蘭·察爾納耶夫
年齡：26歲
目 前情況：傷重死亡 美國總統奧巴馬在美東時間15日15時10分就波士頓爆炸事件發表全國聲明。奧巴馬說，爆炸發生後，美國將全國安保措施升級，雖仍不清楚此次爆炸的肇事者，但奧巴馬誓言會追究責任。並誓言，無論是誰，都會面對正義的制裁。奧巴馬還表示，政府已提升美國安保措施，並表示“美國人民會為波士頓祈禱”。
本次波士頓馬拉松比賽，駐波士頓臺北經濟文化辦事處證實有臺灣選手參賽，包括戴廷聯、杜皆興、葉奕宏、李敬明、林德義、夏海殷、黃凱恕等七位選手，人皆平安。
波士頓田徑協會於晚上8點20分聲明表示，比賽結束後，許多寄物袋仍無人認領，大會將比賽證明領取處設置在波士頓的伯克利街(Berkeley Street)。大會對於每壹位受到影響的參賽者深表歉意，大會將繼續與聯邦執法單位合作，揪出嫌犯。再次感謝世界各地支持與協助波士頓馬拉松的所有人。 據美聯社報道，15日，FAA隨即將現場上空設為禁飛區，同時暫時停止波士頓機場所有入港航班。
當地時間15日下午2點50分馬拉松賽事現場發生爆炸，1小時後FAA將半徑3.5英裏3000英尺以下空域設為禁飛區，隨後降至2.3英裏。
禁飛區何時解除，需等待FAA的進壹步通知。
此外，波士頓機場出港國際航班沒有受到影響，但是加強安檢了，增加了壹些額外的安檢措施。
美國各大機場和火車站都加強了安檢程序。
新澤西交通部門表示：“目前沒有證據顯示交通系統面臨威脅，但是我們已經部署軍裝及便衣警察進行巡查，以保證安全。”