手術室
手術室，有科主任孫吉路等專業學校畢業的麻醉師，有業務嫻熟、搶救經驗豐富的主管護師等技術力量，有進口麻醉機、呼吸機、高頻電刀、電動骨鉆等先進食品和器械，能安全開展全麻 、硬膜外麻醉、臂叢神經麻醉。配合省、市級教授來醫院做大型手術近百次。
放射線科
放射線科，有科副主任、主治醫師劉曉峰等10名醫生、技師，他們攝片質量可靠，診斷準。經常開展各種造影及X線下取異物、骨折復位，最近安裝的美國GE-Ⅲ500毫安X射線診斷系統有影像增強系統和監視系統，性能先進，影像清晰，可提供可靠的診斷依據。
腫瘤科
科主任：李曉瓊
為了提高腫瘤患者的治愈率和生存質量，給腫瘤病人提供方便、有效、良好的治療環境，使腫瘤病人不出甘南就能得到省級腫瘤醫院的化療效果，並可節省近1/3治療費用，甘南縣人民醫院成立了腫瘤內科。選送了臨床業務骨幹的科主任李曉瓊、護土長佟立華分別去哈醫大、天津腫瘤醫院進修深造學習。目前已開展了腫瘤病人術前術後化療業務，醫院並與哈醫大附屬腫瘤醫院結為協作醫院，醫院可隨時為腫瘤患者邀請哈醫大腫瘤醫院專家來甘南縣醫院會診手術。腫瘤內科開展化療業務，乳腺癌、肺癌、食管癌、胃癌、腸癌等術前新輔助化療及術後化療，對晚期的乳腺癌、肺癌、胃癌、腸癌患者可進行化療治療。對不能手術的淋巴癌、胰腺癌及泌尿生殖系腫瘤可化療治療，效果良好。
傳染科
科主任：郭永方
科主任主治醫師郭永方診治傳染病二十多年，成功的搶救了出血熱、暴發型流腦、傷寒等疾病病人近千例，他們鉆研業務，善於學習，他們對各種急慢性傳染病的診治，特別是對流行性出血熱、甲乙型肝炎都有獨特治療方法。
婦科、產科
科主任：科主任宋寧、副主任榮鳳霞
她們精通婦科、產科的疾病的診斷治療，熟練掌握本科高難手術技巧，如子宮肌瘤全切術、新式剖 宮產術、宮外孕搶救手術，只需30分鐘即可完成。在白求恩醫大醫院學到的新式剖宮產術，方法簡單，損傷小、痛苦小、費用低，對頑固性盆腔炎的治療、無痛分娩都有最新技術。
外壹科
科主任：邸西東
他們均獲主治醫師以上職稱，對外科疾病診治經驗豐富，手術技巧嫻熟，他們善於學習，勇於實踐，多次成功的開展腦外傷血腫清除術，各部位骨折固定術、心臟外傷修補術、肝、脾、腎、胃、乳腺、甲狀腺以及直腸、腦瘤、肺葉等大中型手術。九八年又派出醫生到省級醫院專修燒傷治療技術，現外科又增設燒傷病房，為燒傷病人及時搶救提供可靠保障。