虞麗娟教授長期以來主要從事人因工程、體育工程、高等教育管理等方面研究。 主持完成國家、省部級縱向研究課題與橫向科研項目近20項。其中主持完成科技部國家科技支撐計劃1項、上海市科委重點攻關計劃課題1項、上海市科委自然科學基金1項，上海市教委重點科研課題1項，上海市教委教育咨詢課題 4 項；目前正在主持上海市科委重點攻關計劃課題1項。曾獲得國家科技奧運攻關壹等獎、上海市科技進步二等獎、上海市教學成果壹等獎、中國體育科學學會科學技術進步獎二等獎、上海市科教系統思想政治教育研究成果壹等獎、上海市科教系統黨建研究成果壹等獎、上海市高等教育學會研究成果壹等獎。獲得國家科技奧運先進個人等榮譽，出版專著2本，先後在國內外學術刊物發表論文50余篇。
在2012年獲得了國家科學進步獎二等獎，是建國以來，體育界第二位獲此殊榮的學者。