《二十五史與家國興衰》和《萬歷十五年》都是中國歷史研究領域的重要著作，它們之間的異同主要表現在以下幾個方面：
研究對象不同：《二十五史與家國興衰》主要研究的是中國的二十五部官修史書，而《萬歷十五年》則是對明朝萬歷年間的政治、經濟、文化等方面進行深入研究的歷史著作。
研究方法不同：《二十五史與家國興衰》采用了縱向比較和綜合研究的方法，以探究中國歷史文化的演進和變遷規律。而《萬歷十五年》則主要采用了歷史分析和描述的方法，以還原萬歷年間的歷史情境和事件。
研究範圍不同：《二十五史與家國興衰》是壹部非常宏觀和綜合的研究著作，其研究範圍涉及到中國幾千年的歷史文化；而《萬歷十五年》則是對明朝萬歷年間的歷史進行了深入研究，其研究範圍相對較小。
研究目的不同：《二十五史與家國興衰》旨在通過對中國歷史文化的研究，尋找中國的文化根源和民族精神，以期為中國的現代化進程提供啟示和指導；而《萬歷十五年》則旨在對明朝晚期的政治、經濟、文化等方面進行深入的分析，以揭示明朝衰落的原因和歷史啟示。
總的來說，《二十五史與家國興衰》和《萬歷十五年》雖然都是歷史研究的重要著作，但它們的研究對象、方法、範圍和目的都有所不同，反映了作者們對歷史研究的不同理解和關註點。