河海大學校本部位於南京市鼓樓區清涼山北麓,設有西康路校區、江寧校區和常州校區，總占地面積2462畝。
河海大學校本部：位於南京市鼓樓區清涼山北麓，占地800余畝，校園環境優美，綠樹成蔭，花香四季，參天法桐夾道而立。學校先後榮獲全國部門綠化“三百佳”和江蘇省“花園式高校”、“園林式單位”稱號。多次獲得江蘇省文明單位、江蘇省黨建思想政治工作先進集體稱號。
1986年河海大學在江蘇省常州市設立分校，後改為校區。常州校區是河海大學具有較完整辦學功能的重要組成部分，是學校建設高水平特色研究型大學的重要支撐。校區地處江蘇省蘇錫常經濟高速發展地區，位於常州國家高新技術產業開發區，與常州市行政中心比鄰，占地436畝。
河海大學江寧校區教學區位於南京市江寧開發區，占地面積863畝，學生生活區占地面積134畝，教職工住宅占地80畝，總面積1077畝。江寧校區臨近將軍山、秦淮新河，是南京新時期發展的前沿，並與東南大學、南京航空航天大學相鄰。
河海大學簡稱“河海”，是壹所擁有百余年辦學歷史，以水利為特色，工科為主，多學科協調發展的教育部直屬全國重點大學，是實施國家“211工程”重點建設、國家優勢學科創新平臺建設、壹流學科建設以及設立研究生院的高校。