兩者區別：
①大腸菌群系指壹群能發酵乳糖、產酸產氣、需氧和兼性厭氧的革蘭氏陰性無芽孢桿菌。
大腸菌群不是細菌學上的分類命名，而是根據衛生學方面的要求，提出的與糞便汙染有關的細菌，即作為食品、水體等是否受過人畜糞便汙染的指示菌，這些細菌在生化及血清學方面並非完全壹致。根據進壹步的生化試驗，可將這群細菌再分為大腸艾希氏菌（俗稱大腸桿菌）、弗氏檸檬酸桿菌、肺炎克雷伯氏菌和陰溝腸桿菌等。
②大腸桿菌（也稱大腸埃希氏菌），分類於腸桿菌科，歸屬於埃希氏菌屬。
大腸桿菌指革蘭氏陰性無芽孢桿菌、乳糖發酵產酸產氣、imvic試驗（靛基質、mr、v-p、檸檬酸鹽試驗）為+
+
-
-或-
+
-
-的細菌。
與人類有關的大腸桿菌統稱為致瀉性大腸桿菌，包括五種：腸毒素性大腸桿菌（etec）、致病性大腸桿菌（epec）、出血性大腸桿菌（ehec）、侵襲性大腸桿菌（eiec）、黏附性大腸桿菌（eaec）。