上周五，蘋果向使用iTunes軟件的Windows用戶發出提醒，稱在公司發布iTunes升級之前，目前不要急於安裝新款Vista操作系統，原因是此前已有報道稱，Vista與不少媒體播放軟件之間存在兼容性問題。兩日後，蘋果又在其網絡支持論壇上發表聲明稱，如果iPod用戶目前將iTunes軟件運行的Windows 2000或者Windows XP升級到Windows Vista，由於漏洞的存在，可能導致iPod用戶無法從蘋果公司的在線音樂零售店購買、下載音樂，並且無法利用其iTune桌面播放器播放音樂。更為嚴重的是，由於漏洞存在，升級後的Windows Vista操作系統上不支持iPod播放器在桌面電腦上的“安全刪除硬件”功能。蘋果直言不諱地警告說：“這可能損傷到妳的iPod播放器”。
經了解，Vista不兼容的常用的應用程序還有：QuickBooks和LotusNotes、AdobeAcrobat7.0、甚至還有Windows媒體播放器。上月初，還有不少殺毒軟件無法在測試版中使用，但自月中起，賽門鐵克、卡巴斯基、瑞星及金山紛紛完成了平臺對接，並發布了Vista版的殺毒軟件。
此外有遊戲公司稱在Vista系統上無法保存遊戲進度。因為為了確保Vista的安全性，微軟進行了大量的重新設計，另外Vista的數字版權技術也影響了遊戲的正常運行。而由於MSN與QQ的競爭關系，眼下，微軟Vista與騰訊QQ的兼容問題，引起了網民與業內人士的熱議。不少用戶發現，安裝Vista後，登錄QQ壹輸入第四位密碼，機器就會藍屏重啟。對此，微軟方面沒有做出任何回答，而騰訊方面相關負責人則稱：“他們對此暫時不發表意見