（壹）梅裏古鎮的外星來客
梅裏古鎮要舉辦第100屆全球魔術節了，關於外星人要造訪梅裏古鎮的消息不脛而走。魔術節彩排當天發生了壹連串古怪的事情，美南看到外星人在洗澡，艾小博的航天模型撞上了外星飛船……而接下來的故事就更加精彩了，艾小博的航模不僅沒丟，還完好無損地躺在了自家的書桌上，外星人的光臨讓艾小博激動不已。美南的生日禮物竟然是他日思夜想的“外星人機器人”，畢拉拉在參加舞蹈比賽的時候喜獲大獎，全都歸功於外星人小朋友的幫助，就連壹向不相信外星人存在的孟老師，也收獲到了從天而降的外星人麥芽糖，還有神秘的阮丟丟，她有沒有碰到她的外星人朋友呢？這壹切都讓賽恩斯學院的小朋友們應接不暇。
（二）接踵而至的麻煩事
外星人小分隊的到來給小朋友們帶來歡樂的同時，也帶來了壹系列的麻煩事。課堂上美南被吉沓貓調戲了壹番被罰抄字300遍，而吉沓貓暗戀著麥田卻發現麥田喜歡畢拉拉。外星人小分隊的隊員們都被地球上的美食弄得狼狽不堪，為此麥咭因為將廚房弄得亂七八槽而遭到了小博媽媽的斥責，與隊員們走丟的心情讓麥咭覺得無家可歸。麥咭與小博重歸於好後，小博卻收到了奇奇博士要造訪的消息，還好麥咭的能量遊戲讓奇奇博士的陰謀沒有得逞。外星人的能量遊戲帶給小朋友們除了驚奇還有更多，而小分隊的成員們如何找到彼此並回到屬於他們的星球也成為了壹個懸而未決的問題。
（三）啵啰啵啰大派對
隨著麥咭小分隊隊員們和地球上小夥伴們的關系日趨親密和時間壹天天的過去，他們的故事越來越精彩。麥穗發起的“藍牙公主”事件，讓身為主角的畢拉拉壹日間成為電視新聞和報紙的頭條，不僅和仰慕已久的星星哥哥有了零距離的接觸，還轟動了全鎮。校運會上孟老師別有用心的安排卻讓三年（二）班的成績取得了全校第壹名，每個人都發揮出了自己最大的潛力。在神龍塢進行的野外科考，孩子們更是看到了前所未有的景象，美南、阮丟丟和吉沓貓看到了正在降落的UFO，而阮丟丟和吉沓貓更是發現了神秘東方，最讓他們高興的是——他們看到了美麗的流星雨！美南想在科技展上大出風頭，舉辦壹個美食大轉盤的展覽，而麥片卻在為自己回啵啰啵啰星球而忙碌著，美南的展覽舉辦得如何，而麥片有沒有回到啵啰啵啰星球呢？
（四）身份泄露危機
外星人的身份是不宜隨便透露的，以免被別有用心的人利用而傷害到他們。小朋友們個個都守口如瓶，為了保護他們最重要的外星人朋友。但是接下來發生的這壹連串事情，讓外星人的身份陷入了壹次又壹次的危機。孟老師帶著麥芽糖來到了學校，差點被聰明的畢拉拉看出了端倪，學校橘林後面發生的爆炸，不止吸引了孟老師和麥芽糖，奇奇博士和麥咭先後都過去進行了考察，他們究竟發現了什麽呢？美南帶著麥片逛美食街的時候，奇奇博士對他們進行了秘密跟蹤並對麥片的壹舉壹動進行拍照，面對奇奇博士的逼問，美南能否幫麥片逃脫奇奇博士對於外星人的追問？麥田想利用暴風雨來臨的能量找到失散的隊友，他成功了嗎？艾小博每天都有做不完的事情，沒辦法做自己喜歡的事情，麥咭想幫他卻弄巧成拙。畢拉拉自告奮勇報名參加歌唱比賽結果如何呢？
（五）最優搭檔
外星小分隊的隊員們和賽恩斯學院的夥伴們都已經成為了最好的朋友，5個來自啵啰啵啰星球的小隊員們之間相互協調才成為了壹個缺壹不可的整體，他們更是地球上小夥伴們各自的最優搭檔。畢拉拉沒少為巧克力過敏的麥穗操心，而麥咭總是能給艾小博帶來新的驚喜。他們甚至壹起遊覽了壹趟電腦的機箱世界，搶回了將要送入回收站的重要資料。校園文化周活動的神秘獎品讓幾個小夥伴爭先恐後，都回家讓自己的外星人搭檔來幫忙。誰將奪得這次文化周的冠軍將是壹個大家關註的焦點。美南在最憂搭檔麥片的幫助下完成了美術作業從不及格到滿分的蛻變，神龍塢的野餐也讓大家重新認識了真正的友誼。最讓美南擔心的還是麥片的食物，搜遍了包括酷樂園在內的所有地球美食，麥片將找到什麽樣奇怪的食物作為他的最愛呢？
（六）啵啰啵啰星球來襲
麥片在吞下他隨身攜帶的“能量膠囊”之後，輕松化解了“吞皮鞋事件”的危機。壹切看似又恢復了平靜。賽恩斯學院將要舉行以科學發明為主題的比賽，四（2）班的同學們躍躍欲試，大家集思廣益討論參賽的項目。畢拉拉想到可以發明壹臺水資源凈化機，來拯救地球上被汙染的河水。為了收集河水汙染的詳細數據，孟老師、艾小博、畢拉拉、美南和阮丟丟不約而同地帶上自己的外星小夥伴來到梅裏河邊，大家的反常行為，也引來了彼此的猜疑。梅裏古鎮陷入了前所未有的巨大危機中：通訊停滯、信號中斷、寵物傷人……麥咭向艾小博坦白了這壹切都是啵啰啵啰星球發動星球大戰之前的“試探戰”，孟老師、美南等人也在麥芽糖、麥片等先鋒隊員的口中得知了這壹消息。在關鍵時刻，麥咭先鋒隊的能量物品能夠幫助梅裏古鎮平安度過此次危機嗎？
後續故事……
由於先鋒隊員深入地球生活，也給他們近距離真實了解地球環境，尋找“神秘東方”和“冰晶水”資源帶來了方便。但是，他們失望地發現，地球環境已受到嚴重破壞，尤其是水資源的汙染遠遠超越了“啵啰啵啰”星球移民總局和能量總署的預想。他們急需把這些情報發回“啵啰啵啰”星，但是，他們無法與總部取得聯系。另壹個潛在的危機，那就是飛船意外解體後，“啵啰啵啰”星球的移民總局與能量總署誤以為是被地球人擊落，“啵啰啵啰”星球的救援總部正在醞釀壹場對地球的報復性進攻，麥咭隊長在壹次呼叫時得到了這個消息，心急如焚，但因能量不足，無法將他們真實的情況發回總部……