牡丹花的顏色有紅色、黃色、白色、藍色、粉色、紫色等等。
1、紅色
紅色花系，是牡丹園的大家族，品種多達200余個，其中還有深淺之分。如“壹品朱衣”，猩紅欲流，芳冠百花；“春紅嬌艷”，朝霞藏日，光彩陸離；“紅繡球”，深淺相間，胭脂染成。
2、黃色
黃色花系，如“姚黃”“金玉交章”，端莊典雅，姿貌絕倫。
3、白色
白色花系如“冰壺獻玉”“昆山夜光”“玉板白”等素潔無瑕，清爽襲人。
4、藍色
藍色花系雖不如紅色品種多。但卻也姐妹成群。“藍寶石”“藍花魁”“紫藍葵”“吊枝藍”“冷光藍”“藍田玉”，都是牡丹之中的上品，這“藍田玉”就是清代曹州花農趙玉田精心培育而成的。
5、粉色
粉色花系也是牡丹園裏壹大分支。“粉彩球”“粉容面”“粉翠球”“賽鬥珠”“翠娥嬌”“青龍臥粉池”，這些都是牡丹花中名品。再如“趙粉”，稍彎曲的枝幹，粗壯的花梗，黃綠色的葉面，圓尖型的花蕾，側開、大型的花朵，細膩整齊的花瓣，發出陣出清香，分外誘人。
6、紫色
紫色花系在菏澤牡丹品種繁多，除魏紫外，還有“葛巾紫”“紫金盤”“紫霞點金”“邦寧紫”等。“邦寧紫”，就是明代曹州花農趙邦寧多年心血的結晶。