第二屆董事 由時任福建省省長的 胡平 擔任董事長
第三屆董事會任期從1992年10月至1997年10月，由時任福建省委書記 賈慶林 擔任董事長
第四屆董事會任期從1997年10月至2002年12月，由時任福建省委書記 陳明義 擔任董事長
第五屆董事會於2002年12月成立，由時任福建省委書記 宋德福 擔任董事長。第五屆董事會現有董事102名，其中海外董事84名，來自菲律賓、泰國、印度尼西亞、馬來西亞、新加坡、柬埔寨、緬甸、日本、美國、加拿大、西班牙、澳大利亞、巴西、香港、澳門等15個國家和地區。
歷任校長
1廖承誌 1960/10 1983/6/10 中***十二屆中央政治局委員、原全國人大副委員長
2韋愨 1964/4 1970/1 原教育部副部長，在校期間任副校長、代校長
3葉飛 1983/10 1988/8 原福建省省委書記、開國上將
4陳覺萬 1988/8 1993/8 我國著名教育管理學家
5莊善裕 1993/8 1999/12 我國著名民法學專家
6吳承業 1999/12 2008/12/10 我國著名數量經濟學家
7丘進 2008/12/10 現任 原國務院僑辦文教司司長、西安交通大學黨委副書記、副校長