2. 電子賬冊每個周期核減；加工貿易手冊到期或合同執行完核銷。
3. 電子賬冊比加工貿易手冊使用起來更方便，海關監管起來更嚴密。
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1、電子賬冊的簡述：電子賬冊聯網監管是壹種新型的進出口管理模式，由於與原來的紙質手冊操作辦法有較大差異，因此在出口退(免)稅系統中不能按原紙質手冊的登記、核銷方法進行操作。海關以企業界為單元為聯網企業建立的電子底賬，實施電子帳冊管理的，聯網企業只設立壹個電子帳冊。海關應當根據聯網企業的生產情況和海關的監管需要確定核銷周期，按照核銷周期對實行電子帳冊管理的聯網企業進行核銷管理。自2006年9月1日起實行中期核查制度，企業每月底均需向海關申報料號以及物料的庫存數據。
2、電子賬冊的操作：
余料結轉的操作
電子賬冊每壹個核銷周期的“結余料件”的確定和申報方法如下：對於轉出的金額，企業可以按《加工貿易電子賬冊正式報核申請表》中的“期末結余料件額”欄的金額在《生產企業進料加工海關登記手冊核銷申請表》的“應調減進口料件金額——結轉至其它手冊料件”欄錄入反映。轉出的同時必須要錄入對應的轉入金額，企業可以在下壹階段手冊中虛擬壹正數進口報關單進行申報，金額與上述轉出額壹致。
剩余邊角料的操作
根據企業剩余邊角料的海關代征增值稅的完稅憑證計算核定出電子賬冊該核銷階段應調減的進口料件金額，再將此金額在《生產企業進料加工海關登記手冊核銷申請表》的“應調減進口料件金額——剩余邊角余料”欄中錄入反映。
3、加工貿易手冊簡述：《加工貿易手冊》是要在申請以前交6000RMB並準備好以下材料前去錄入：營業執照副本、組織機構代碼證副本、資格證書副本；來料加工合同；來料登記申請表（加工企業備案信息表、經營企業備案信息表、加工企業生產能力證明、經營企業生產能力證明）；驗資報告。