福建農林大學王牌專業有農學、植物保護、林學、茶學、生物科學、生物工程、食品科學與工程、風景園林、園藝、園林、動物醫學、蜂學、機械設計制造及其自動化、制藥工程、生物技術、輕化工程、食品質量與安全、農業資源與環境、生態學、農林經濟管理、木材科學與工程等。
壹流本科專業建設點（國家級+省級）
5個專業入選國家級壹流本科專業建設點：金融學、森林保護、農林經濟管理、公***事業管理、產品設計
7個專業入選福建省壹流本科專業建設點：材料科學與工程、土木工程、交通工程、環境工程、會計學、旅遊管理、動畫
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