要有效地預防傳染病的發生與流行，關鍵在於切斷傳染病流行的三個環節形成的傳播鏈。為此，要切實做到：
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1、養成良好的衛生習慣，提高自我防病能力。
2、 加強體育鍛煉，增強對傳染病的抵抗力。
3、 按規定進行預防接種，提高免疫力。
4、 搞好環境衛生，消滅傳播疾病的蚊、蠅、鼠、蟑螂等害蟲。
5、 傳染病人要早發現、早報告、早診斷、早隔離、早治療、防止交叉感染。
6、 傳染病人接觸過的用品及居室均嚴格消毒。
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控制傳染病最高效的方式在於防控，由於在傳染病的三個基本條件中，缺乏任何壹個都無法造成傳染病的流行，所以對於傳染病預防也主要集中在這三個方面：
控制傳染源：這是預防傳染病的最有效方式。對於人類傳染源的傳染病，需要及時將病人或病源攜帶者妥善的安排在指定的隔離位置，暫時與人群隔離，積極進行治療，護理，並對具有傳染性的分泌物，排泄物和用具等進行必要的消毒處理，防止病原體向外擴散。
然而，如果是未知傳染源，特別是動物擔任的傳染源，由於其確定需要流行病學的因果推斷和實驗室檢測結果上得到充分的證據，有的時候並不是很容易得到確切結果，尤其是突發急性傳染病發生時，想要短時間內鎖定傳染源更是困難。不過，壹旦確定傳染源後，需要及時采取高效的措施控制傳染源，以保證傳染源不會繼續將病原體向易感人群播散。
切斷傳播途徑：對於通過消化道傳染病、血液和體液傳播的傳染病，蟲媒傳染病和寄生蟲病等，切斷傳播途徑是最為直接的預防方式。主要方式在於對於傳播媒介阻斷，消毒或撲殺。如對於汙染了病原體的食物或飲水要進行丟棄或消毒處理，對於汙染了病原體的房間或用具要進行充分的消毒，對於壹次性的醫療用品在使用後要及時進行消毒或焚燒等無害化處理，在蟲媒傳染病傳播季節采取防蚊防蟲措施等。
同時，對於高危人群的健康教育幹預手段也是極為必要的，如促進靜脈註射吸毒人群對使用針具進行消毒，對會發生高危性行為的人群進行安全套使用的宣傳教育等。
保護易感人群：保護易感人群也是傳染病預防重要組成部分，而且往往是較為容易實現的預防方法。對於已經有預防性疫苗的傳染病，給易感人群接種疫苗是最為保險的方法，如嬰兒在出生後進行的計劃免疫，對於傳染科醫生，護士，從事傳染性疾病研究的科研人員和從事禽類養殖工作的人員等接種相應的疫苗。
歷史上，人們利用高效的疫苗已經成功的攻克了天花，證明對於易感人群的保護在傳染病防治上起到了重要角色。對於沒有預防性疫苗的傳染病，對於易感人群的保護可以采取改善營養，加強鍛煉等提高機體非特異性免疫力的方式進行，必要時也可以采取對易感人群的暫時隔離。
影響傳染病流行過程的因素很多，這包括了自然因素和社會因素，如環境，氣候，社會經濟條件，人民生活水平，人口流動，交通方式等等。隨著生物醫學水平的不斷提高，對於傳染性疾病，人們已經擁有越來越高效的預防性疫苗和治療藥物，極大的提高了疾病的預防和治療成功率。