1、壹些企業在購銷過程中，結算方式多用現金為主，不開發票，不記賬，在申報納稅時隱瞞銷售收入。同時，企業財務核算不規範，庫存商品管理比較混亂，賬面庫存與實物不符等。
2、行業利潤較低。由於市場競爭比較劇烈，有些企業為了獲得市場，放棄部分利潤，降低銷售價格，有壹些行業具胡季節性的，產品在淡季裏，價格也會比旺季時要低，利潤也低薄。
3、會計期間進貨量多，造成進項稅額增大。有壹些企業由於簽定了大額供貨合同，必須購進大量的原材料備庫，而有壹些是因為企業內部管理的原因造成庫存物資增加，比如對市場的預測，估計原材料會漲價，大量采購物資儲備，還有壹些是采購和生產、銷售管理脫節，盲目進貨。
4、市場因素影響，比如企業市場萎縮，銷售不旺造成產品積壓、企業銷售合同無法履行(訂貨方退貨造成銷售額下降，但是進項稅已經確認)等，都是企業稅負抵的原因。
5、原料市場價格變化，進貨價格上漲，進貨價格上漲，可以抵扣的進項稅額也會增加，但是，企業要想調高銷售價格卻面臨市場壓力，或者是銷售價格在銷售合同中已經定了，在這種情況下，銷項稅減進項稅的差額也就少了，稅負率就降低了。
增值稅稅負率的計算公式:稅負率=(銷項稅額-進項稅額)/不含稅銷售收入*100%