1. 版權問題。在國內，黑糖瑪奇朵沒有版權，各影視平臺沒有購買版權，因此遭到版權起訴，只能將黑糖瑪奇朵下架。
2. 原材料成本上漲。黑糖瑪奇朵的主要原材料是黑糖，而黑糖的價格受到市場波動的影響，如果價格波動過大，星巴克可能難以承受成本壓力，不得不下架這款飲品。
3. 口感不穩定。黑糖瑪奇朵的制作過程相對復雜，需要嚴格掌控每個環節的時間和溫度，才能制作出口感壹致的飲品。但因為人工操作容易出現誤差，加上不同門店的制作標準存在差異，有時候消費者在不同門店購買到的黑糖瑪奇朵口感存在差異。
4. 違規收集個人信息。2022年4月30日，我國公信部公布了《工信部下架常見問題整改方案匯總》，黑糖瑪奇朵因涉嫌違規收集個人信息被強制下架。