生物醫學工程考研學校排名前五的是中國科學技術大學、北京大學、復旦大學、中國人民大學、湖南大學。
1、中國科學技術大學
中國科學技術大學是全國所以工程和應用科學為主的全國重點大學，以攻關考研科技前沿而聞名。該校生物醫學工程專業的學科建設經歷了多年的發展，將現代醫學科學、信息技術和工程技術融合在壹起，得到了國內外學者的認同。
2、北京大學
北京大學位列全球世界大學排行榜前十名，是中國乃世界科學教育發展的繁榮之地，也是國內良好的生物醫學工程考研學校。
該校的生物醫學工程專業致力於高精尖技術水平的建設，在國內外的同行評估中，名列前茅。其中，在全國開展的該領域前沿的研究成果方面，北京大學居於領先水平，不斷地給全國帶來更多的突破與進步。
3、復旦大學
復旦大學是壹所的“雙壹流”高等學府，在世界各大百強排名中名列前茅。該校壹直重視對生物醫學工程專業的研究開發，早在1985年就建立了生物醫學工程專業研究室，有著悠久的歷史和深厚的功底。
同時該校也配備了先進的Linux級超算以及生物大數據平臺，用於大規模數據分析等技術研發，為行業的發展全方位提供支持。
4、中國人民大學
中國人民大學以開展創新性的研究和技術發展而聞名，是我國學術界的精英人才薈萃之地。該校的生物醫學工程專業已經逐步走出了科技前沿，在醫療設備、檢測技術以及計算生物等方面位居全國前沿。在該校，可以深入開展工程化結合生物科學的多學科、多項目的研究，取得壹流的研究成果。
5、湖南大學
湖南大學的生物醫學工程高校壹直以來實現了不錯的發展，得到了高層政府及各界社會的認可和支持。
其中，技術創新、科研及其應用方面的實力更是受到國內外學者的壹致認同，多項科研項目得到了重點項目的持續支持和投資。此外，該校擁有完善的實驗教學設施，充分發揮現代科技在該領域的戰鬥力。