1、範圍不同：“語言學及應用語言學”更側重於語言學和現代漢語，而“漢語言文字學”則側重於古代漢語和文字方面，目前對外漢語教學大多設在語言學與應用語言學下面，是其壹個分支。
2、熱度不同：壹個是側重於對語言的考察，壹個側重於對文字的專研和了解，比如篆書，甲骨等。兩個方向考的書目步壹樣，文字學比較冷門。壹個研究語言包括方言研究，普通話和方言的對比等，文字學主要研究文字，包括篆書，甲骨文等。
3、內容不同：壹個研究語言包括方言研究，普通話和方言的對比等，文字學主要研究文字，包括篆書，甲骨文等。主要還有就是現代漢語語法方面的東西。語言學及應用語言學下面還有些方向，現在比較火的是對外漢語。很多人考這個專業也就是沖著這個方向去的。文字學相對於要枯燥些，他們的課程設置很多和古漢有關，壹些訓詁，釋意，說文之類的內容。
百度百科-語言學及應用語言學
百度百科-漢語言文字學