有機化合物的種類如此龐雜，必然難於記憶。然而它的命名是有壹定規律的，下面我們就來了解壹下有機化合物的命名規則。通常情況下，有機化合物的命名規則有以下3種方法。
俗名及縮寫
有些化合物常根據它的來源而以俗名命名之，要掌握壹些常用俗名所代表的化合物的結構式。如：木醇是甲醇的俗稱，酒精（乙醇）、甘醇（乙二醇）、甘油（丙三醇）、石炭酸（苯酚）、蟻酸（甲酸）、水楊醛（鄰羥基苯甲醛）、肉桂醛（β?苯基丙烯醛）、巴豆醛（2?丁烯醛）、水楊酸（鄰羥基苯甲酸）、氯仿（三氯甲烷）、草酸（乙二酸）、苦味酸（2，4，6-三硝基苯酚）、甘氨酸（α-氨基乙酸）、丙氨酸（α-氨基丙酸）、谷氨酸（α-氨基戊二酸）、D-葡萄糖、D-果糖（用費歇爾投影式表示糖的開鏈結構）等。還有壹些化合物常用它的縮寫及商品名稱，如：RNA（核糖核酸）、DNA（脫氧核糖核酸）、阿司匹林（乙酰水楊酸）、煤酚皂或來蘇兒（47%~53%的3種甲酚的肥皂水溶液）、福爾馬林（40%的甲醛水溶液）、撲熱息痛（對羥基乙酰苯胺）、尼古丁（煙堿）等。
普通命名（習慣命名）法
要求掌握“正、異、新”、“伯、仲、叔、季”等字頭的含義及用法。
正：代表直鏈烷烴。
伯：只與1個碳相連的碳原子稱伯碳原子。
仲：與2個碳相連的碳原子稱仲碳原子。
叔：與3個碳相連的碳原子稱叔碳原子。
季：與4個碳相連的碳原子稱季碳原子。
要掌握常見烴基的結構，如：烯丙基、丙烯基、正丙基、異丙基、異丁基、叔丁基、芐基等。
系統命名法
系統命名法是有機化合物命名的重點，①必須熟練掌握各類化合物的命名原則。其中以烴類的命名為基礎，幾何異構體、光學異構體和多官能團化合物的命名是難點，應引起重視。②要牢記命名中所遵循的“次序規則”。
烷烴的命名
烷烴的命名是所有開鏈烴及其衍生物命名的基礎。
命名的步驟及原則：
（1）選主鏈。選擇最長的碳鏈為主鏈，有幾條相同的碳鏈時，應選擇含取代基多的碳鏈為主鏈。
（2）編號。給主鏈編號時，從離取代基最近的壹端開始。若有幾種可能的情況，應使各取代基都有盡可能小的編號或取代基位次數之和最小。
（3）書寫名稱。以阿拉伯數字表示取代基的位次，先寫出取代基的位次及名稱，再寫烷烴的名稱；有多個取代基時，簡單的在前，復雜的在後，相同的取代基合並寫出，用漢字數字表示相同取代基的個數；阿拉伯數字與漢字之間用半字線隔開。
幾何異構體的命名
因雙鍵或環碳原子的單鍵不能自由旋轉而引起的異構體稱為幾何異構體，又稱順反異構體。
烯烴幾何異構體的命名包括順、反和Z、E兩種方法。
簡單的化合物可以用順、反表示，也可以用Z、E表示。用順、反表示時，相同的原子或基團在雙鍵碳原子同側的為順式，反之為反式。
如果雙鍵碳原子上所連4個基團都不相同時，不能用順反表示，只能用Z、E表示。按照“次序規則”比較兩對基團的優先順序，兩個較優基團在雙鍵碳原子同側的為Z型，反之為E型。必須註意，順、反和Z、E是2種不同的表示方法，不存在必然的內在聯系。有的化合物可以用順、反表示，也可以用Z、E表示，順式的不壹定是Z型，反式的也不壹定是E型。
脂環化合物也存在順反異構體，2個取代基在環平面的同側為順式，反之為反式。